Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LLGL2Q6P1M3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms