Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntn4Q69Z26 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntn4Q69Z26 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntn4Q69Z26 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntn4Q69Z26 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntn4Q69Z26 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntn4Q69Z26 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntn4Q69Z26 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntn4Q69Z26 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntn4Q69Z26 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntn4Q69Z26 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntn4Q69Z26 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntn4Q69Z26 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntn4Q69Z26 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cntn4Q69Z26 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn4Q69Z26 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms