Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc55Q3UY51 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms