Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 CPR4YCR069W 957 nt3.86□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 ARF2YDL137W 546 nt3.86□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 COX18YGR062C 951 nt3.86□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 COX2Q0250 756 nt3.86□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 JJJ3YJR097W 519 nt3.86□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 SAP30YMR263W 606 nt3.86□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 ECM7YLR443W 1347 nt3.86□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 ERG4YGL012W 1422 nt3.86□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 SKM1YOL113W 1968 nt3.85□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 MAG2YLR427W 2013 nt3.85□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 RIM4YHL024W 2142 nt3.85□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 FMP25YLR077W 1752 nt3.85□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 TEL1YBL088C 8364 nt3.85□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 RPP1AYDL081C 321 nt3.85□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 YGR066CYGR066C 879 nt3.85□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 PXR1YGR280C 816 nt3.85□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 COA3YJL062W-A 258 nt3.85□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 NMA1YLR328W 1206 nt3.85□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 SHE1YBL031W 1017 nt3.85□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 SIW14YNL032W 846 nt3.85□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 POP3YNL282W 588 nt3.85□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 UTP23YOR004W 765 nt3.85□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 UMP1YBR173C 447 nt3.85□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 ABP140YOR239W 1887 nt3.85□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 YTM1YOR272W 1383 nt3.85□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 PMT5YDL093W 2232 nt3.85□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 SIS2YKR072C 1689 nt3.84□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 NUP42YDR192C 1293 nt3.84□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 CIA2YHR122W 696 nt3.84□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.84□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 DBR1YKL149C 1218 nt3.84□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 KTR2YKR061W 1278 nt3.84□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 YBL059WYBL059W 582 nt3.84□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 SPS19YNL202W 879 nt3.84□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 KIP3YGL216W 2418 nt3.84□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 NOP58YOR310C 1536 nt3.84□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 APC1YNL172W 5247 nt3.83□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 OPT2YPR194C 2634 nt3.83□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 ACP1YKL192C 378 nt3.83□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt3.83□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 YHR177WYHR177W 1362 nt3.83□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 IOC2YLR095C 2439 nt3.83□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 MLH2YLR035C 2088 nt3.82□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 SSH4YKL124W 1740 nt3.82□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 YBR139WYBR139W 1527 nt3.82□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 HIS6YIL020C 786 nt3.82□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 RGS2YOR107W 930 nt3.82□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 ECM23YPL021W 564 nt3.82□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 SRG1SRG1 551 nt3.81□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 ISY1YJR050W 708 nt3.81□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 YNK1YKL067W 462 nt3.81□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 YAR023CYAR023C 540 nt3.81□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 KRE5YOR336W 4098 nt3.81□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 RPB2YOR151C 3675 nt3.81□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 CEG1YGL130W 1380 nt3.8□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 SRP72YPL210C 1923 nt3.8□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 ECM32YER176W 3366 nt3.8□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 TAF10YDR167W 621 nt3.8□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 PIC2YER053C 903 nt3.8□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 RPL24AYGL031C 468 nt3.8□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 LOH1YJL038C 660 nt3.8□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 IDP2YLR174W 1239 nt3.8□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 SPO19YPL130W 672 nt3.8□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 YPR071WYPR071W 636 nt3.8□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 YMR221CYMR221C 1515 nt3.8□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 FPK1YNR047W 2682 nt3.79□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 YLH47YPR125W 1365 nt3.79□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 RPL14AYKL006W 417 nt3.79□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 ELF1YKL160W 438 nt3.79□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 PCL1YNL289W 840 nt3.79□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 CIN5YOR028C 888 nt3.79□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 ICY2YPL250C 411 nt3.79□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 MRPS9YBR146W 837 nt3.79□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 FYV5YCL058C 459 nt3.79□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 CHD1YER164W 4407 nt3.79□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 CBF5YLR175W 1452 nt3.79□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 YPS7YDR349C 1791 nt3.79□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 PTA1YAL043C 2358 nt3.78□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 PUT2YHR037W 1728 nt3.78□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 YDL012CYDL012C 324 nt3.78□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 YJU2YKL095W 837 nt3.78□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 TAF11YML015C 1041 nt3.78□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 SUI1YNL244C 327 nt3.78□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 RAD17YOR368W 1206 nt3.78□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 RDH54YBR073W 2877 nt3.78□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 YNL247WYNL247W 2304 nt3.78□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 PRP31YGR091W 1485 nt3.78□□□□□ -1.8
RTR2Q12378 KEX1YGL203C 2190 nt3.78□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 HIS4YCL030C 2400 nt3.78□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 KRE29YER038C 1395 nt3.77□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 SAT4YCR008W 1812 nt3.77□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 NMD3YHR170W 1557 nt3.77□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 ENT5YDR153C 1236 nt3.77□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 YGL188CYGL188C 174 nt3.77□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt3.77□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt3.77□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt3.77□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt3.77□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt3.77□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.4 ms