Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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