Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cited1P97769 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cited1P97769 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cited1P97769 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cited1P97769 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cited1P97769 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cited1P97769 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cited1P97769 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cited1P97769 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cited1P97769 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cited1P97769 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited1P97769 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited1P97769 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited1P97769 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited1P97769 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited1P97769 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited1P97769 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited1P97769 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited1P97769 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited1P97769 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cited1P97769 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited1P97769 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cited1P97769 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cited1P97769 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited1P97769 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cited1P97769 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cited1P97769 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cited1P97769 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cited1P97769 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cited1P97769 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cited1P97769 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cited1P97769 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cited1P97769 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cited1P97769 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cited1P97769 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cited1P97769 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cited1P97769 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cited1P97769 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cited1P97769 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cited1P97769 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cited1P97769 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cited1P97769 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cited1P97769 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cited1P97769 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cited1P97769 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cited1P97769 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cited1P97769 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cited1P97769 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms