Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CRB1P82279 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CRB1P82279 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CRB1P82279 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CRB1P82279 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CRB1P82279 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CRB1P82279 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CRB1P82279 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CRB1P82279 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CRB1P82279 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CRB1P82279 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CRB1P82279 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CRB1P82279 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CRB1P82279 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CRB1P82279 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CRB1P82279 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CRB1P82279 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CRB1P82279 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CRB1P82279 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CRB1P82279 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CRB1P82279 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CRB1P82279 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CRB1P82279 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CRB1P82279 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CRB1P82279 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CRB1P82279 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CRB1P82279 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CRB1P82279 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CRB1P82279 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CRB1P82279 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CRB1P82279 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CRB1P82279 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CRB1P82279 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CRB1P82279 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CRB1P82279 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CRB1P82279 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CRB1P82279 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CRB1P82279 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CRB1P82279 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CRB1P82279 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CRB1P82279 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CRB1P82279 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CRB1P82279 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CRB1P82279 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CRB1P82279 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CRB1P82279 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CRB1P82279 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CRB1P82279 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CRB1P82279 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CRB1P82279 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CRB1P82279 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CRB1P82279 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CRB1P82279 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CRB1P82279 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CRB1P82279 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CRB1P82279 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CRB1P82279 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CRB1P82279 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CRB1P82279 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CRB1P82279 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CRB1P82279 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CRB1P82279 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CRB1P82279 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CRB1P82279 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CRB1P82279 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CRB1P82279 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CRB1P82279 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CRB1P82279 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CRB1P82279 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CRB1P82279 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CRB1P82279 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CRB1P82279 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CRB1P82279 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CRB1P82279 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CRB1P82279 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CRB1P82279 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CRB1P82279 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CRB1P82279 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CRB1P82279 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CRB1P82279 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CRB1P82279 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CRB1P82279 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CRB1P82279 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CRB1P82279 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CRB1P82279 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CRB1P82279 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CRB1P82279 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CRB1P82279 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CRB1P82279 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CRB1P82279 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CRB1P82279 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CRB1P82279 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CRB1P82279 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CRB1P82279 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CRB1P82279 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CRB1P82279 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CRB1P82279 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CRB1P82279 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CRB1P82279 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CRB1P82279 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms