Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm3P62311 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms