Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRCA2P51587 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms