Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brca1P48754 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brca1P48754 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brca1P48754 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brca1P48754 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brca1P48754 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brca1P48754 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brca1P48754 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Brca1P48754 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brca1P48754 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brca1P48754 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brca1P48754 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brca1P48754 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms