Protein–RNA interactions for Protein: P32380

SPC110, Spindle pole body component 110, yeast

Predictions only

Length 944 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPC110	P32380	SWI3	YJL176C	2478 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SPC110	P32380	YHR177W	YHR177W	1362 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SPC110	P32380	PRM7	YDL039C	2097 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SPC110	P32380	KCC4	YCL024W	3114 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SPC110	P32380	YER133W-A	YER133W-A	342 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SPC110	P32380	YGR011W	YGR011W	327 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SPC110	P32380	FMP48	YGR052W	1110 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SPC110	P32380	MRPL25	YGR076C	474 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SPC110	P32380	YNL234W	YNL234W	1281 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SPC110	P32380	YNR042W	YNR042W	429 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SPC110	P32380	snR3	snR3	194 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SPC110	P32380	SRO7	YPR032W	3102 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SPC110	P32380	ALG6	YOR002W	1635 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SPC110	P32380	tX(XXX)D	tX(XXX)D	100 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SPC110	P32380	MRPL39	YML009C	213 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SPC110	P32380	AIF1	YNR074C	1137 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SPC110	P32380	DCS2	YOR173W	1062 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SPC110	P32380	RKM4	YDR257C	1485 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SPC110	P32380	IBA57	YJR122W	1494 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SPC110	P32380	PCL6	YER059W	1263 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	AAD6	YFL056C	639 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	TYW3	YGL050W	822 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YMR010W	YMR010W	1218 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	NDJ1	YOL104C	1059 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YPL014W	YPL014W	1146 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YBR141W-A	YBR141W-A	96 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	MAD3	YJL013C	1548 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	ALD3	YMR169C	1521 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	ALD2	YMR170C	1521 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YBR139W	YBR139W	1527 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	IMD2	YHR216W	1572 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	TIP20	YGL145W	2106 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	MLF3	YNL074C	1359 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YDL109C	YDL109C	1944 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	TAF7	YMR227C	1773 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YCF1	YDR135C	4548 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	COQ4	YDR204W	1008 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	UIP3	YAR027W	708 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YMR114C	YMR114C	1107 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	ECM22	YLR228C	2445 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	DXO1	YDR370C	1329 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	PMT5	YDL093W	2232 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	HER2	YMR293C	1395 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	OMS1	YDR316W	1416 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	SPO77	YLR341W	1434 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	APC1	YNL172W	5247 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YDL027C	YDL027C	1263 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	NUP42	YDR192C	1293 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YEL074W	YEL074W	339 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	SAP30	YMR263W	606 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YBR016W	YBR016W	387 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	CDC14	YFR028C	1656 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	HO	YDL227C	1761 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	OSH2	YDL019C	3852 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	SPT23	YKL020C	3249 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YDR445C	YDR445C	408 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YER134C	YER134C	537 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YFR034W-A	YFR034W-A	288 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YIL014C-A	YIL014C-A	315 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YKL169C	YKL169C	384 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YAR030C	YAR030C	342 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	ECM15	YBL001C	315 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	ATG33	YLR356W	594 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	SPC24	YMR117C	642 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	ROT1	YMR200W	771 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	SUA7	YPR086W	1038 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	snR34	snR34	203 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	TCO89	YPL180W	2400 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	HIS4	YCL030C	2400 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YCR023C	YCR023C	1836 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YDR056C	YDR056C	618 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	tS(AGA)D3	tS(AGA)D3	83 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YIF1	YNL263C	945 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YPL025C	YPL025C	558 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	ATG14	YBR128C	1035 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	REI1	YBR267W	1182 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	PRM1	YNL279W	1986 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	RTC1	YOL138C	4026 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YET2	YMR040W	483 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	CLD1	YGR110W	1338 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	SAS4	YDR181C	1446 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	TDA11	YHR159W	1515 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	NOC2	YOR206W	2133 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	STB2	YMR053C	2553 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	GAL11	YOL051W	3246 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	MTR10	YOR160W	2919 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	NMD3	YHR170W	1557 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	YCR075W-A	YCR075W-A	228 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	TRM8	YDL201W	861 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	BUD13	YGL174W	801 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	ADD66	YKL206C	804 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	ECM32	YER176W	3366 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SPC110	P32380	MAG2	YLR427W	2013 nt		4.84	□□□□□ -1.64
SPC110	P32380	ARC1	YGL105W	1131 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SPC110	P32380	YMR105W-A	YMR105W-A	195 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SPC110	P32380	YNL217W	YNL217W	981 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SPC110	P32380	MGR2	YPL098C	342 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SPC110	P32380	UMP1	YBR173C	447 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SPC110	P32380	PEX30	YLR324W	1572 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SPC110	P32380	HUL4	YJR036C	2679 nt		4.82	□□□□□ -1.64

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