Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gadd45bP22339 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms