Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXB8P17481 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms