Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fv4P11370 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Fv4P11370 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fv4P11370 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fv4P11370 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fv4P11370 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fv4P11370 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fv4P11370 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms