Protein–RNA interactions for Protein: P09813

Apoa2, Apolipoprotein A-II, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa2P09813 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa2P09813 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa2P09813 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa2P09813 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa2P09813 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa2P09813 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa2P09813 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa2P09813 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa2P09813 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa2P09813 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa2P09813 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa2P09813 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa2P09813 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa2P09813 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Apoa2P09813 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa2P09813 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa2P09813 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa2P09813 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa2P09813 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa2P09813 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa2P09813 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa2P09813 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms