Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30O88574 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30O88574 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30O88574 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30O88574 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30O88574 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30O88574 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30O88574 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sap30O88574 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30O88574 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30O88574 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sap30O88574 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sap30O88574 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sap30O88574 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sap30O88574 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms