Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efna5O08543 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna5O08543 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efna5O08543 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efna5O08543 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efna5O08543 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efna5O08543 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efna5O08543 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efna5O08543 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna5O08543 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efna5O08543 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms