Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP0

Zfp708, Zinc finger protein 708, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp708F8VPP0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp708F8VPP0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp708F8VPP0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp708F8VPP0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp708F8VPP0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp708F8VPP0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp708F8VPP0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp708F8VPP0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp708F8VPP0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp708F8VPP0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp708F8VPP0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp708F8VPP0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp708F8VPP0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp708F8VPP0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp708F8VPP0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp708F8VPP0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp708F8VPP0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms