Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm28048F7BCN0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms