Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Odf2A3KGV1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms