Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrit3W8DXL4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrit3W8DXL4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrit3W8DXL4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrit3W8DXL4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrit3W8DXL4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrit3W8DXL4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrit3W8DXL4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrit3W8DXL4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrit3W8DXL4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrit3W8DXL4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrit3W8DXL4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrit3W8DXL4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrit3W8DXL4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrit3W8DXL4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrit3W8DXL4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrit3W8DXL4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrit3W8DXL4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrit3W8DXL4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrit3W8DXL4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrit3W8DXL4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrit3W8DXL4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrit3W8DXL4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrit3W8DXL4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrit3W8DXL4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrit3W8DXL4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrit3W8DXL4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrit3W8DXL4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrit3W8DXL4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrit3W8DXL4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrit3W8DXL4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrit3W8DXL4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrit3W8DXL4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrit3W8DXL4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrit3W8DXL4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrit3W8DXL4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrit3W8DXL4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrit3W8DXL4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrit3W8DXL4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrit3W8DXL4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrit3W8DXL4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrit3W8DXL4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrit3W8DXL4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrit3W8DXL4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrit3W8DXL4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrit3W8DXL4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrit3W8DXL4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrit3W8DXL4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrit3W8DXL4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrit3W8DXL4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrit3W8DXL4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrit3W8DXL4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrit3W8DXL4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrit3W8DXL4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrit3W8DXL4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrit3W8DXL4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrit3W8DXL4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrit3W8DXL4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrit3W8DXL4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrit3W8DXL4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrit3W8DXL4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrit3W8DXL4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrit3W8DXL4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrit3W8DXL4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrit3W8DXL4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrit3W8DXL4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrit3W8DXL4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrit3W8DXL4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrit3W8DXL4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrit3W8DXL4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrit3W8DXL4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrit3W8DXL4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrit3W8DXL4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrit3W8DXL4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrit3W8DXL4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrit3W8DXL4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrit3W8DXL4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrit3W8DXL4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrit3W8DXL4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrit3W8DXL4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrit3W8DXL4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrit3W8DXL4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrit3W8DXL4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrit3W8DXL4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrit3W8DXL4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrit3W8DXL4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrit3W8DXL4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrit3W8DXL4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrit3W8DXL4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrit3W8DXL4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrit3W8DXL4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrit3W8DXL4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrit3W8DXL4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit3W8DXL4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit3W8DXL4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit3W8DXL4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit3W8DXL4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit3W8DXL4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrit3W8DXL4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrit3W8DXL4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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