Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm28036V9GXJ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm28036V9GXJ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm28036V9GXJ1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm28036V9GXJ1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm28036V9GXJ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm28036V9GXJ1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gm28036V9GXJ1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gm28036V9GXJ1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm28036V9GXJ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm28036V9GXJ1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm28036V9GXJ1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gm28036V9GXJ1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gm28036V9GXJ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gm28036V9GXJ1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gm28036V9GXJ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gm28036V9GXJ1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gm28036V9GXJ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gm28036V9GXJ1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm28036V9GXJ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gm28036V9GXJ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gm28036V9GXJ1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gm28036V9GXJ1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gm28036V9GXJ1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm28036V9GXJ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm28036V9GXJ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm28036V9GXJ1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gm28036V9GXJ1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Gm28036V9GXJ1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm28036V9GXJ1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm28036V9GXJ1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm28036V9GXJ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm28036V9GXJ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm28036V9GXJ1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm28036V9GXJ1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm28036V9GXJ1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm28036V9GXJ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm28036V9GXJ1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm28036V9GXJ1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm28036V9GXJ1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm28036V9GXJ1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm28036V9GXJ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm28036V9GXJ1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm28036V9GXJ1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm28036V9GXJ1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm28036V9GXJ1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm28036V9GXJ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm28036V9GXJ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm28036V9GXJ1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm28036V9GXJ1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm28036V9GXJ1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm28036V9GXJ1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm28036V9GXJ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm28036V9GXJ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm28036V9GXJ1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm28036V9GXJ1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm28036V9GXJ1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm28036V9GXJ1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm28036V9GXJ1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm28036V9GXJ1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm28036V9GXJ1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm28036V9GXJ1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm28036V9GXJ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm28036V9GXJ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm28036V9GXJ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm28036V9GXJ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm28036V9GXJ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm28036V9GXJ1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gm28036V9GXJ1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm28036V9GXJ1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm28036V9GXJ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm28036V9GXJ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Gm28036V9GXJ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm28036V9GXJ1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm28036V9GXJ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm28036V9GXJ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm28036V9GXJ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gm28036V9GXJ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gm28036V9GXJ1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gm28036V9GXJ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gm28036V9GXJ1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gm28036V9GXJ1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gm28036V9GXJ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gm28036V9GXJ1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm28036V9GXJ1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gm28036V9GXJ1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gm28036V9GXJ1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gm28036V9GXJ1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm28036V9GXJ1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm28036V9GXJ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gm28036V9GXJ1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gm28036V9GXJ1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gm28036V9GXJ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gm28036V9GXJ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gm28036V9GXJ1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gm28036V9GXJ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
Gm28036V9GXJ1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm28036V9GXJ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gm28036V9GXJ1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gm28036V9GXJ1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.1 ms