Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Top3bQ9Z321 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Top3bQ9Z321 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top3bQ9Z321 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top3bQ9Z321 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Top3bQ9Z321 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top3bQ9Z321 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top3bQ9Z321 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Top3bQ9Z321 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Top3bQ9Z321 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Top3bQ9Z321 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Top3bQ9Z321 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Top3bQ9Z321 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Top3bQ9Z321 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Top3bQ9Z321 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Top3bQ9Z321 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Top3bQ9Z321 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top3bQ9Z321 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top3bQ9Z321 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top3bQ9Z321 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Top3bQ9Z321 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Top3bQ9Z321 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Top3bQ9Z321 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Top3bQ9Z321 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Top3bQ9Z321 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Top3bQ9Z321 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top3bQ9Z321 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top3bQ9Z321 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top3bQ9Z321 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top3bQ9Z321 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top3bQ9Z321 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top3bQ9Z321 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top3bQ9Z321 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top3bQ9Z321 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top3bQ9Z321 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top3bQ9Z321 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top3bQ9Z321 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top3bQ9Z321 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top3bQ9Z321 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Top3bQ9Z321 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Top3bQ9Z321 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Top3bQ9Z321 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Top3bQ9Z321 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top3bQ9Z321 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top3bQ9Z321 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Top3bQ9Z321 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Top3bQ9Z321 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top3bQ9Z321 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top3bQ9Z321 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top3bQ9Z321 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top3bQ9Z321 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top3bQ9Z321 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Top3bQ9Z321 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top3bQ9Z321 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Top3bQ9Z321 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Top3bQ9Z321 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Top3bQ9Z321 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Top3bQ9Z321 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top3bQ9Z321 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top3bQ9Z321 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Top3bQ9Z321 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top3bQ9Z321 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top3bQ9Z321 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top3bQ9Z321 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top3bQ9Z321 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top3bQ9Z321 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top3bQ9Z321 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top3bQ9Z321 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Top3bQ9Z321 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top3bQ9Z321 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top3bQ9Z321 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top3bQ9Z321 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top3bQ9Z321 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top3bQ9Z321 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top3bQ9Z321 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top3bQ9Z321 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top3bQ9Z321 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top3bQ9Z321 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top3bQ9Z321 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top3bQ9Z321 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top3bQ9Z321 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top3bQ9Z321 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top3bQ9Z321 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top3bQ9Z321 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top3bQ9Z321 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Top3bQ9Z321 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top3bQ9Z321 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top3bQ9Z321 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top3bQ9Z321 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top3bQ9Z321 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top3bQ9Z321 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Top3bQ9Z321 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top3bQ9Z321 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Top3bQ9Z321 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top3bQ9Z321 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top3bQ9Z321 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top3bQ9Z321 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top3bQ9Z321 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top3bQ9Z321 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top3bQ9Z321 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms