Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cib2Q9Z309 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cib2Q9Z309 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cib2Q9Z309 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cib2Q9Z309 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cib2Q9Z309 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cib2Q9Z309 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cib2Q9Z309 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cib2Q9Z309 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cib2Q9Z309 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cib2Q9Z309 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cib2Q9Z309 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cib2Q9Z309 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cib2Q9Z309 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cib2Q9Z309 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cib2Q9Z309 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cib2Q9Z309 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cib2Q9Z309 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cib2Q9Z309 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cib2Q9Z309 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cib2Q9Z309 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cib2Q9Z309 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cib2Q9Z309 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cib2Q9Z309 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cib2Q9Z309 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cib2Q9Z309 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cib2Q9Z309 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cib2Q9Z309 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cib2Q9Z309 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cib2Q9Z309 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cib2Q9Z309 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cib2Q9Z309 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cib2Q9Z309 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cib2Q9Z309 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cib2Q9Z309 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cib2Q9Z309 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cib2Q9Z309 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cib2Q9Z309 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cib2Q9Z309 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cib2Q9Z309 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cib2Q9Z309 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cib2Q9Z309 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cib2Q9Z309 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cib2Q9Z309 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cib2Q9Z309 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cib2Q9Z309 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cib2Q9Z309 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cib2Q9Z309 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cib2Q9Z309 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cib2Q9Z309 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cib2Q9Z309 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cib2Q9Z309 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cib2Q9Z309 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cib2Q9Z309 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cib2Q9Z309 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cib2Q9Z309 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cib2Q9Z309 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cib2Q9Z309 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cib2Q9Z309 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cib2Q9Z309 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cib2Q9Z309 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cib2Q9Z309 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cib2Q9Z309 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cib2Q9Z309 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cib2Q9Z309 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cib2Q9Z309 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cib2Q9Z309 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cib2Q9Z309 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cib2Q9Z309 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cib2Q9Z309 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cib2Q9Z309 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cib2Q9Z309 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cib2Q9Z309 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cib2Q9Z309 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cib2Q9Z309 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cib2Q9Z309 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cib2Q9Z309 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cib2Q9Z309 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cib2Q9Z309 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cib2Q9Z309 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cib2Q9Z309 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cib2Q9Z309 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cib2Q9Z309 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cib2Q9Z309 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cib2Q9Z309 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cib2Q9Z309 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cib2Q9Z309 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cib2Q9Z309 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cib2Q9Z309 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cib2Q9Z309 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cib2Q9Z309 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cib2Q9Z309 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cib2Q9Z309 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cib2Q9Z309 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cib2Q9Z309 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cib2Q9Z309 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cib2Q9Z309 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cib2Q9Z309 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cib2Q9Z309 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cib2Q9Z309 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms