Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z204

Hnrnpc, Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpcQ9Z204 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
HnrnpcQ9Z204 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
HnrnpcQ9Z204 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
HnrnpcQ9Z204 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
HnrnpcQ9Z204 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
HnrnpcQ9Z204 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
HnrnpcQ9Z204 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
HnrnpcQ9Z204 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
HnrnpcQ9Z204 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,12■■□□□ 1,61
HnrnpcQ9Z204 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,11■■□□□ 1,61
HnrnpcQ9Z204 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,06■■□□□ 1,6
HnrnpcQ9Z204 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
HnrnpcQ9Z204 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
HnrnpcQ9Z204 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
HnrnpcQ9Z204 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
HnrnpcQ9Z204 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
HnrnpcQ9Z204 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
HnrnpcQ9Z204 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
HnrnpcQ9Z204 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1,59
HnrnpcQ9Z204 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
HnrnpcQ9Z204 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
HnrnpcQ9Z204 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
HnrnpcQ9Z204 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
HnrnpcQ9Z204 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
HnrnpcQ9Z204 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
HnrnpcQ9Z204 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
HnrnpcQ9Z204 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
HnrnpcQ9Z204 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
HnrnpcQ9Z204 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
HnrnpcQ9Z204 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
HnrnpcQ9Z204 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
HnrnpcQ9Z204 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
HnrnpcQ9Z204 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,58
HnrnpcQ9Z204 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
HnrnpcQ9Z204 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
HnrnpcQ9Z204 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24,85■■□□□ 1,57
HnrnpcQ9Z204 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
HnrnpcQ9Z204 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
HnrnpcQ9Z204 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
HnrnpcQ9Z204 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
HnrnpcQ9Z204 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
HnrnpcQ9Z204 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
HnrnpcQ9Z204 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
HnrnpcQ9Z204 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
HnrnpcQ9Z204 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
HnrnpcQ9Z204 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
HnrnpcQ9Z204 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
HnrnpcQ9Z204 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
HnrnpcQ9Z204 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
HnrnpcQ9Z204 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
HnrnpcQ9Z204 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
HnrnpcQ9Z204 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
HnrnpcQ9Z204 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
HnrnpcQ9Z204 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
HnrnpcQ9Z204 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
HnrnpcQ9Z204 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24,74■■□□□ 1,55
HnrnpcQ9Z204 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24,74■■□□□ 1,55
HnrnpcQ9Z204 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
HnrnpcQ9Z204 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
HnrnpcQ9Z204 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
HnrnpcQ9Z204 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
HnrnpcQ9Z204 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
HnrnpcQ9Z204 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
HnrnpcQ9Z204 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
HnrnpcQ9Z204 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
HnrnpcQ9Z204 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,65■■□□□ 1,54
HnrnpcQ9Z204 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
HnrnpcQ9Z204 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,63■■□□□ 1,53
HnrnpcQ9Z204 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
HnrnpcQ9Z204 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
HnrnpcQ9Z204 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
HnrnpcQ9Z204 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24,6■■□□□ 1,53
HnrnpcQ9Z204 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
HnrnpcQ9Z204 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
HnrnpcQ9Z204 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
HnrnpcQ9Z204 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
HnrnpcQ9Z204 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
HnrnpcQ9Z204 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
HnrnpcQ9Z204 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
HnrnpcQ9Z204 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
HnrnpcQ9Z204 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
HnrnpcQ9Z204 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
HnrnpcQ9Z204 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24,52■■□□□ 1,52
HnrnpcQ9Z204 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,51■■□□□ 1,51
HnrnpcQ9Z204 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,51■■□□□ 1,51
HnrnpcQ9Z204 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
HnrnpcQ9Z204 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
HnrnpcQ9Z204 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
HnrnpcQ9Z204 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,48■■□□□ 1,51
HnrnpcQ9Z204 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
HnrnpcQ9Z204 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
HnrnpcQ9Z204 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
HnrnpcQ9Z204 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
HnrnpcQ9Z204 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24,47■■□□□ 1,51
HnrnpcQ9Z204 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
HnrnpcQ9Z204 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
HnrnpcQ9Z204 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
HnrnpcQ9Z204 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24,45■■□□□ 1,5
HnrnpcQ9Z204 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,43■■□□□ 1,5
HnrnpcQ9Z204 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33,7 ms