Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Atp1a4Q9WV27 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Atp1a4Q9WV27 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Atp1a4Q9WV27 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Atp1a4Q9WV27 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Atp1a4Q9WV27 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Atp1a4Q9WV27 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Atp1a4Q9WV27 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Atp1a4Q9WV27 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Atp1a4Q9WV27 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Atp1a4Q9WV27 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,53■■■□□ 2,32
Atp1a4Q9WV27 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Atp1a4Q9WV27 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Atp1a4Q9WV27 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Atp1a4Q9WV27 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Atp1a4Q9WV27 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Atp1a4Q9WV27 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Atp1a4Q9WV27 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Atp1a4Q9WV27 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Atp1a4Q9WV27 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Atp1a4Q9WV27 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Atp1a4Q9WV27 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Atp1a4Q9WV27 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Atp1a4Q9WV27 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Atp1a4Q9WV27 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Atp1a4Q9WV27 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Atp1a4Q9WV27 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
Atp1a4Q9WV27 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Atp1a4Q9WV27 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Atp1a4Q9WV27 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Atp1a4Q9WV27 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Atp1a4Q9WV27 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Atp1a4Q9WV27 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,33■■■□□ 2,29
Atp1a4Q9WV27 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Atp1a4Q9WV27 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Atp1a4Q9WV27 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Atp1a4Q9WV27 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Atp1a4Q9WV27 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Atp1a4Q9WV27 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Atp1a4Q9WV27 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Atp1a4Q9WV27 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Atp1a4Q9WV27 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Atp1a4Q9WV27 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Atp1a4Q9WV27 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Atp1a4Q9WV27 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Atp1a4Q9WV27 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Atp1a4Q9WV27 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Atp1a4Q9WV27 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Atp1a4Q9WV27 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Atp1a4Q9WV27 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Atp1a4Q9WV27 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Atp1a4Q9WV27 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Atp1a4Q9WV27 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Atp1a4Q9WV27 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Atp1a4Q9WV27 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Atp1a4Q9WV27 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Atp1a4Q9WV27 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29■■■□□ 2,23
Atp1a4Q9WV27 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,98■■■□□ 2,23
Atp1a4Q9WV27 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Atp1a4Q9WV27 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Atp1a4Q9WV27 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Atp1a4Q9WV27 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Atp1a4Q9WV27 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Atp1a4Q9WV27 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Atp1a4Q9WV27 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Atp1a4Q9WV27 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Atp1a4Q9WV27 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Atp1a4Q9WV27 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Atp1a4Q9WV27 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Atp1a4Q9WV27 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Atp1a4Q9WV27 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Atp1a4Q9WV27 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Atp1a4Q9WV27 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Atp1a4Q9WV27 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Atp1a4Q9WV27 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Atp1a4Q9WV27 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Atp1a4Q9WV27 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
Atp1a4Q9WV27 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Atp1a4Q9WV27 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,87■■■□□ 2,21
Atp1a4Q9WV27 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Atp1a4Q9WV27 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Atp1a4Q9WV27 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Atp1a4Q9WV27 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Atp1a4Q9WV27 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,82■■■□□ 2,2
Atp1a4Q9WV27 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Atp1a4Q9WV27 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Atp1a4Q9WV27 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Atp1a4Q9WV27 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Atp1a4Q9WV27 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Atp1a4Q9WV27 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Atp1a4Q9WV27 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Atp1a4Q9WV27 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Atp1a4Q9WV27 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Atp1a4Q9WV27 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Atp1a4Q9WV27 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Atp1a4Q9WV27 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Atp1a4Q9WV27 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Atp1a4Q9WV27 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Atp1a4Q9WV27 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Atp1a4Q9WV27 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,7 ms