Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Pcm1Q9R0L6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Pcm1Q9R0L6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Pcm1Q9R0L6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Pcm1Q9R0L6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Pcm1Q9R0L6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Pcm1Q9R0L6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Pcm1Q9R0L6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Pcm1Q9R0L6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Pcm1Q9R0L6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Pcm1Q9R0L6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Pcm1Q9R0L6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Pcm1Q9R0L6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
Pcm1Q9R0L6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Pcm1Q9R0L6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Pcm1Q9R0L6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26,95■■□□□ 1,91
Pcm1Q9R0L6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Pcm1Q9R0L6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Pcm1Q9R0L6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Pcm1Q9R0L6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Pcm1Q9R0L6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Pcm1Q9R0L6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,89
Pcm1Q9R0L6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,89■■□□□ 1,89
Pcm1Q9R0L6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Pcm1Q9R0L6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Pcm1Q9R0L6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Pcm1Q9R0L6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Pcm1Q9R0L6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,88
Pcm1Q9R0L6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Pcm1Q9R0L6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Pcm1Q9R0L6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Pcm1Q9R0L6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Pcm1Q9R0L6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Pcm1Q9R0L6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Pcm1Q9R0L6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Pcm1Q9R0L6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Pcm1Q9R0L6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Pcm1Q9R0L6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Pcm1Q9R0L6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Pcm1Q9R0L6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Pcm1Q9R0L6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,76■■□□□ 1,87
Pcm1Q9R0L6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Pcm1Q9R0L6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Pcm1Q9R0L6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Pcm1Q9R0L6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Pcm1Q9R0L6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Pcm1Q9R0L6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Pcm1Q9R0L6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Pcm1Q9R0L6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Pcm1Q9R0L6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26,64■■□□□ 1,86
Pcm1Q9R0L6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Pcm1Q9R0L6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Pcm1Q9R0L6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Pcm1Q9R0L6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Pcm1Q9R0L6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Pcm1Q9R0L6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Pcm1Q9R0L6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Pcm1Q9R0L6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Pcm1Q9R0L6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Pcm1Q9R0L6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Pcm1Q9R0L6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26,56■■□□□ 1,84
Pcm1Q9R0L6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Pcm1Q9R0L6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Pcm1Q9R0L6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Pcm1Q9R0L6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Pcm1Q9R0L6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Pcm1Q9R0L6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Pcm1Q9R0L6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Pcm1Q9R0L6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Pcm1Q9R0L6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,51■■□□□ 1,83
Pcm1Q9R0L6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Pcm1Q9R0L6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Pcm1Q9R0L6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Pcm1Q9R0L6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Pcm1Q9R0L6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Pcm1Q9R0L6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26,42■■□□□ 1,82
Pcm1Q9R0L6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Pcm1Q9R0L6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Pcm1Q9R0L6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Pcm1Q9R0L6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Pcm1Q9R0L6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Pcm1Q9R0L6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Pcm1Q9R0L6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Pcm1Q9R0L6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Pcm1Q9R0L6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Pcm1Q9R0L6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Pcm1Q9R0L6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Pcm1Q9R0L6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Pcm1Q9R0L6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Pcm1Q9R0L6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Pcm1Q9R0L6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Pcm1Q9R0L6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Pcm1Q9R0L6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Pcm1Q9R0L6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Pcm1Q9R0L6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Pcm1Q9R0L6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Pcm1Q9R0L6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Pcm1Q9R0L6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,8
Pcm1Q9R0L6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Pcm1Q9R0L6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms