Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcm1Q9R0L6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcm1Q9R0L6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcm1Q9R0L6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcm1Q9R0L6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcm1Q9R0L6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcm1Q9R0L6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcm1Q9R0L6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcm1Q9R0L6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcm1Q9R0L6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcm1Q9R0L6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcm1Q9R0L6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcm1Q9R0L6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcm1Q9R0L6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcm1Q9R0L6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcm1Q9R0L6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pcm1Q9R0L6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pcm1Q9R0L6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcm1Q9R0L6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcm1Q9R0L6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcm1Q9R0L6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcm1Q9R0L6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pcm1Q9R0L6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pcm1Q9R0L6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcm1Q9R0L6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcm1Q9R0L6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcm1Q9R0L6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcm1Q9R0L6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Pcm1Q9R0L6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcm1Q9R0L6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcm1Q9R0L6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcm1Q9R0L6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcm1Q9R0L6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcm1Q9R0L6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcm1Q9R0L6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcm1Q9R0L6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcm1Q9R0L6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcm1Q9R0L6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcm1Q9R0L6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcm1Q9R0L6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcm1Q9R0L6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcm1Q9R0L6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcm1Q9R0L6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcm1Q9R0L6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcm1Q9R0L6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcm1Q9R0L6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcm1Q9R0L6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pcm1Q9R0L6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pcm1Q9R0L6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pcm1Q9R0L6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Pcm1Q9R0L6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pcm1Q9R0L6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcm1Q9R0L6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcm1Q9R0L6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcm1Q9R0L6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcm1Q9R0L6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcm1Q9R0L6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcm1Q9R0L6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcm1Q9R0L6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcm1Q9R0L6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcm1Q9R0L6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcm1Q9R0L6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcm1Q9R0L6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcm1Q9R0L6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcm1Q9R0L6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcm1Q9R0L6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcm1Q9R0L6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcm1Q9R0L6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcm1Q9R0L6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcm1Q9R0L6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcm1Q9R0L6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcm1Q9R0L6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcm1Q9R0L6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcm1Q9R0L6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcm1Q9R0L6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pcm1Q9R0L6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcm1Q9R0L6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcm1Q9R0L6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcm1Q9R0L6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcm1Q9R0L6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcm1Q9R0L6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pcm1Q9R0L6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pcm1Q9R0L6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pcm1Q9R0L6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pcm1Q9R0L6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pcm1Q9R0L6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcm1Q9R0L6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pcm1Q9R0L6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pcm1Q9R0L6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcm1Q9R0L6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcm1Q9R0L6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcm1Q9R0L6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcm1Q9R0L6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcm1Q9R0L6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcm1Q9R0L6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcm1Q9R0L6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcm1Q9R0L6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcm1Q9R0L6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Pcm1Q9R0L6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcm1Q9R0L6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms