Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CtsfQ9R013 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CtsfQ9R013 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CtsfQ9R013 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CtsfQ9R013 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CtsfQ9R013 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CtsfQ9R013 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CtsfQ9R013 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CtsfQ9R013 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CtsfQ9R013 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CtsfQ9R013 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CtsfQ9R013 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CtsfQ9R013 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CtsfQ9R013 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CtsfQ9R013 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CtsfQ9R013 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CtsfQ9R013 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CtsfQ9R013 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CtsfQ9R013 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CtsfQ9R013 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CtsfQ9R013 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CtsfQ9R013 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CtsfQ9R013 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CtsfQ9R013 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CtsfQ9R013 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CtsfQ9R013 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CtsfQ9R013 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CtsfQ9R013 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CtsfQ9R013 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CtsfQ9R013 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CtsfQ9R013 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CtsfQ9R013 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CtsfQ9R013 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CtsfQ9R013 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CtsfQ9R013 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CtsfQ9R013 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CtsfQ9R013 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CtsfQ9R013 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CtsfQ9R013 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CtsfQ9R013 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CtsfQ9R013 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CtsfQ9R013 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CtsfQ9R013 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CtsfQ9R013 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CtsfQ9R013 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CtsfQ9R013 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CtsfQ9R013 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CtsfQ9R013 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CtsfQ9R013 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CtsfQ9R013 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CtsfQ9R013 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CtsfQ9R013 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CtsfQ9R013 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CtsfQ9R013 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CtsfQ9R013 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CtsfQ9R013 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CtsfQ9R013 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CtsfQ9R013 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CtsfQ9R013 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CtsfQ9R013 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CtsfQ9R013 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CtsfQ9R013 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CtsfQ9R013 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CtsfQ9R013 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CtsfQ9R013 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CtsfQ9R013 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CtsfQ9R013 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CtsfQ9R013 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CtsfQ9R013 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CtsfQ9R013 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CtsfQ9R013 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CtsfQ9R013 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CtsfQ9R013 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CtsfQ9R013 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CtsfQ9R013 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CtsfQ9R013 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CtsfQ9R013 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CtsfQ9R013 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CtsfQ9R013 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CtsfQ9R013 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CtsfQ9R013 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CtsfQ9R013 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CtsfQ9R013 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CtsfQ9R013 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CtsfQ9R013 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CtsfQ9R013 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CtsfQ9R013 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CtsfQ9R013 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CtsfQ9R013 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CtsfQ9R013 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CtsfQ9R013 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CtsfQ9R013 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CtsfQ9R013 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CtsfQ9R013 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CtsfQ9R013 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CtsfQ9R013 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CtsfQ9R013 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CtsfQ9R013 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CtsfQ9R013 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CtsfQ9R013 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms