Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rdh11Q9QYF1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rdh11Q9QYF1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rdh11Q9QYF1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rdh11Q9QYF1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rdh11Q9QYF1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rdh11Q9QYF1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rdh11Q9QYF1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rdh11Q9QYF1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rdh11Q9QYF1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rdh11Q9QYF1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rdh11Q9QYF1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rdh11Q9QYF1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rdh11Q9QYF1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rdh11Q9QYF1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rdh11Q9QYF1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rdh11Q9QYF1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rdh11Q9QYF1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rdh11Q9QYF1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rdh11Q9QYF1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rdh11Q9QYF1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rdh11Q9QYF1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rdh11Q9QYF1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rdh11Q9QYF1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rdh11Q9QYF1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rdh11Q9QYF1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rdh11Q9QYF1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rdh11Q9QYF1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rdh11Q9QYF1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rdh11Q9QYF1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rdh11Q9QYF1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rdh11Q9QYF1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rdh11Q9QYF1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rdh11Q9QYF1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rdh11Q9QYF1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rdh11Q9QYF1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rdh11Q9QYF1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rdh11Q9QYF1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rdh11Q9QYF1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rdh11Q9QYF1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rdh11Q9QYF1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rdh11Q9QYF1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rdh11Q9QYF1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rdh11Q9QYF1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rdh11Q9QYF1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rdh11Q9QYF1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rdh11Q9QYF1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rdh11Q9QYF1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rdh11Q9QYF1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rdh11Q9QYF1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rdh11Q9QYF1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rdh11Q9QYF1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rdh11Q9QYF1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rdh11Q9QYF1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rdh11Q9QYF1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rdh11Q9QYF1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rdh11Q9QYF1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rdh11Q9QYF1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rdh11Q9QYF1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rdh11Q9QYF1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rdh11Q9QYF1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Rdh11Q9QYF1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rdh11Q9QYF1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rdh11Q9QYF1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rdh11Q9QYF1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rdh11Q9QYF1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rdh11Q9QYF1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rdh11Q9QYF1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rdh11Q9QYF1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rdh11Q9QYF1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rdh11Q9QYF1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rdh11Q9QYF1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rdh11Q9QYF1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rdh11Q9QYF1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rdh11Q9QYF1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rdh11Q9QYF1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rdh11Q9QYF1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rdh11Q9QYF1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rdh11Q9QYF1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rdh11Q9QYF1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rdh11Q9QYF1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rdh11Q9QYF1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rdh11Q9QYF1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rdh11Q9QYF1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rdh11Q9QYF1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rdh11Q9QYF1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rdh11Q9QYF1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rdh11Q9QYF1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rdh11Q9QYF1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rdh11Q9QYF1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rdh11Q9QYF1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rdh11Q9QYF1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rdh11Q9QYF1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rdh11Q9QYF1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rdh11Q9QYF1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rdh11Q9QYF1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rdh11Q9QYF1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rdh11Q9QYF1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rdh11Q9QYF1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rdh11Q9QYF1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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