Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW9

Slc7a8, Large neutral amino acids transporter small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a8Q9QXW9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc7a8Q9QXW9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc7a8Q9QXW9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc7a8Q9QXW9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc7a8Q9QXW9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc7a8Q9QXW9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc7a8Q9QXW9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc7a8Q9QXW9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc7a8Q9QXW9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc7a8Q9QXW9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc7a8Q9QXW9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc7a8Q9QXW9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc7a8Q9QXW9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc7a8Q9QXW9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc7a8Q9QXW9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc7a8Q9QXW9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc7a8Q9QXW9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc7a8Q9QXW9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc7a8Q9QXW9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc7a8Q9QXW9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc7a8Q9QXW9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc7a8Q9QXW9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc7a8Q9QXW9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc7a8Q9QXW9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc7a8Q9QXW9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc7a8Q9QXW9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc7a8Q9QXW9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc7a8Q9QXW9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc7a8Q9QXW9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc7a8Q9QXW9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc7a8Q9QXW9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc7a8Q9QXW9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc7a8Q9QXW9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc7a8Q9QXW9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc7a8Q9QXW9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc7a8Q9QXW9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc7a8Q9QXW9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc7a8Q9QXW9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc7a8Q9QXW9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc7a8Q9QXW9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc7a8Q9QXW9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc7a8Q9QXW9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc7a8Q9QXW9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc7a8Q9QXW9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc7a8Q9QXW9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc7a8Q9QXW9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc7a8Q9QXW9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc7a8Q9QXW9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc7a8Q9QXW9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc7a8Q9QXW9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc7a8Q9QXW9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc7a8Q9QXW9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc7a8Q9QXW9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc7a8Q9QXW9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc7a8Q9QXW9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc7a8Q9QXW9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc7a8Q9QXW9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc7a8Q9QXW9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc7a8Q9QXW9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc7a8Q9QXW9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc7a8Q9QXW9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc7a8Q9QXW9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc7a8Q9QXW9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc7a8Q9QXW9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc7a8Q9QXW9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc7a8Q9QXW9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc7a8Q9QXW9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc7a8Q9QXW9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc7a8Q9QXW9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc7a8Q9QXW9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc7a8Q9QXW9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc7a8Q9QXW9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc7a8Q9QXW9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc7a8Q9QXW9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc7a8Q9QXW9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc7a8Q9QXW9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc7a8Q9QXW9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc7a8Q9QXW9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc7a8Q9QXW9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc7a8Q9QXW9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc7a8Q9QXW9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc7a8Q9QXW9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc7a8Q9QXW9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc7a8Q9QXW9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc7a8Q9QXW9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc7a8Q9QXW9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc7a8Q9QXW9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc7a8Q9QXW9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc7a8Q9QXW9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc7a8Q9QXW9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc7a8Q9QXW9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc7a8Q9QXW9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc7a8Q9QXW9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc7a8Q9QXW9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc7a8Q9QXW9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc7a8Q9QXW9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc7a8Q9QXW9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc7a8Q9QXW9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc7a8Q9QXW9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc7a8Q9QXW9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms