Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fscn3Q9QXW4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fscn3Q9QXW4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Fscn3Q9QXW4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fscn3Q9QXW4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fscn3Q9QXW4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fscn3Q9QXW4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fscn3Q9QXW4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fscn3Q9QXW4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fscn3Q9QXW4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fscn3Q9QXW4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fscn3Q9QXW4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fscn3Q9QXW4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fscn3Q9QXW4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fscn3Q9QXW4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fscn3Q9QXW4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fscn3Q9QXW4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fscn3Q9QXW4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fscn3Q9QXW4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fscn3Q9QXW4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fscn3Q9QXW4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fscn3Q9QXW4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fscn3Q9QXW4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fscn3Q9QXW4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fscn3Q9QXW4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fscn3Q9QXW4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fscn3Q9QXW4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fscn3Q9QXW4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fscn3Q9QXW4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fscn3Q9QXW4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fscn3Q9QXW4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fscn3Q9QXW4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fscn3Q9QXW4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fscn3Q9QXW4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fscn3Q9QXW4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fscn3Q9QXW4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fscn3Q9QXW4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fscn3Q9QXW4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fscn3Q9QXW4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fscn3Q9QXW4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fscn3Q9QXW4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fscn3Q9QXW4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fscn3Q9QXW4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fscn3Q9QXW4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fscn3Q9QXW4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fscn3Q9QXW4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fscn3Q9QXW4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fscn3Q9QXW4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fscn3Q9QXW4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fscn3Q9QXW4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fscn3Q9QXW4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fscn3Q9QXW4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fscn3Q9QXW4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fscn3Q9QXW4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fscn3Q9QXW4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fscn3Q9QXW4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fscn3Q9QXW4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fscn3Q9QXW4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fscn3Q9QXW4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fscn3Q9QXW4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fscn3Q9QXW4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fscn3Q9QXW4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fscn3Q9QXW4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fscn3Q9QXW4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fscn3Q9QXW4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fscn3Q9QXW4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fscn3Q9QXW4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fscn3Q9QXW4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fscn3Q9QXW4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fscn3Q9QXW4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fscn3Q9QXW4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fscn3Q9QXW4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fscn3Q9QXW4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fscn3Q9QXW4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fscn3Q9QXW4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fscn3Q9QXW4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fscn3Q9QXW4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fscn3Q9QXW4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fscn3Q9QXW4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fscn3Q9QXW4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fscn3Q9QXW4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fscn3Q9QXW4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fscn3Q9QXW4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fscn3Q9QXW4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fscn3Q9QXW4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fscn3Q9QXW4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fscn3Q9QXW4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fscn3Q9QXW4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fscn3Q9QXW4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fscn3Q9QXW4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fscn3Q9QXW4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fscn3Q9QXW4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fscn3Q9QXW4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fscn3Q9QXW4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fscn3Q9QXW4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fscn3Q9QXW4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fscn3Q9QXW4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fscn3Q9QXW4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fscn3Q9QXW4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fscn3Q9QXW4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms