Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rabgef1Q9JM13 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rabgef1Q9JM13 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rabgef1Q9JM13 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rabgef1Q9JM13 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rabgef1Q9JM13 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rabgef1Q9JM13 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rabgef1Q9JM13 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rabgef1Q9JM13 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rabgef1Q9JM13 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rabgef1Q9JM13 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rabgef1Q9JM13 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rabgef1Q9JM13 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rabgef1Q9JM13 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rabgef1Q9JM13 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rabgef1Q9JM13 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rabgef1Q9JM13 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rabgef1Q9JM13 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rabgef1Q9JM13 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rabgef1Q9JM13 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rabgef1Q9JM13 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rabgef1Q9JM13 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rabgef1Q9JM13 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rabgef1Q9JM13 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rabgef1Q9JM13 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rabgef1Q9JM13 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rabgef1Q9JM13 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Rabgef1Q9JM13 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rabgef1Q9JM13 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rabgef1Q9JM13 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Rabgef1Q9JM13 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rabgef1Q9JM13 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rabgef1Q9JM13 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rabgef1Q9JM13 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rabgef1Q9JM13 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rabgef1Q9JM13 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rabgef1Q9JM13 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rabgef1Q9JM13 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rabgef1Q9JM13 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rabgef1Q9JM13 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rabgef1Q9JM13 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rabgef1Q9JM13 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rabgef1Q9JM13 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rabgef1Q9JM13 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rabgef1Q9JM13 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rabgef1Q9JM13 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rabgef1Q9JM13 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rabgef1Q9JM13 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rabgef1Q9JM13 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rabgef1Q9JM13 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rabgef1Q9JM13 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rabgef1Q9JM13 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rabgef1Q9JM13 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rabgef1Q9JM13 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rabgef1Q9JM13 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rabgef1Q9JM13 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rabgef1Q9JM13 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rabgef1Q9JM13 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rabgef1Q9JM13 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rabgef1Q9JM13 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rabgef1Q9JM13 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rabgef1Q9JM13 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rabgef1Q9JM13 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rabgef1Q9JM13 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rabgef1Q9JM13 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rabgef1Q9JM13 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
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