Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cacng4Q9JJV4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cacng4Q9JJV4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cacng4Q9JJV4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cacng4Q9JJV4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cacng4Q9JJV4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Cacng4Q9JJV4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cacng4Q9JJV4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cacng4Q9JJV4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cacng4Q9JJV4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cacng4Q9JJV4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cacng4Q9JJV4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cacng4Q9JJV4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Cacng4Q9JJV4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cacng4Q9JJV4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cacng4Q9JJV4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cacng4Q9JJV4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cacng4Q9JJV4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cacng4Q9JJV4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cacng4Q9JJV4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cacng4Q9JJV4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cacng4Q9JJV4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cacng4Q9JJV4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cacng4Q9JJV4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cacng4Q9JJV4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cacng4Q9JJV4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cacng4Q9JJV4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacng4Q9JJV4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacng4Q9JJV4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cacng4Q9JJV4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cacng4Q9JJV4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cacng4Q9JJV4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cacng4Q9JJV4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cacng4Q9JJV4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cacng4Q9JJV4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cacng4Q9JJV4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cacng4Q9JJV4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacng4Q9JJV4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacng4Q9JJV4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cacng4Q9JJV4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cacng4Q9JJV4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacng4Q9JJV4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacng4Q9JJV4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacng4Q9JJV4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cacng4Q9JJV4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacng4Q9JJV4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cacng4Q9JJV4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cacng4Q9JJV4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cacng4Q9JJV4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cacng4Q9JJV4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cacng4Q9JJV4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cacng4Q9JJV4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cacng4Q9JJV4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cacng4Q9JJV4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cacng4Q9JJV4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cacng4Q9JJV4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cacng4Q9JJV4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cacng4Q9JJV4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cacng4Q9JJV4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cacng4Q9JJV4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cacng4Q9JJV4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cacng4Q9JJV4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cacng4Q9JJV4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacng4Q9JJV4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacng4Q9JJV4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacng4Q9JJV4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cacng4Q9JJV4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacng4Q9JJV4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacng4Q9JJV4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cacng4Q9JJV4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cacng4Q9JJV4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cacng4Q9JJV4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cacng4Q9JJV4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cacng4Q9JJV4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacng4Q9JJV4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cacng4Q9JJV4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacng4Q9JJV4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cacng4Q9JJV4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cacng4Q9JJV4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cacng4Q9JJV4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cacng4Q9JJV4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cacng4Q9JJV4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cacng4Q9JJV4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cacng4Q9JJV4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacng4Q9JJV4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacng4Q9JJV4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacng4Q9JJV4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cacng4Q9JJV4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacng4Q9JJV4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacng4Q9JJV4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacng4Q9JJV4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cacng4Q9JJV4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cacng4Q9JJV4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cacng4Q9JJV4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cacng4Q9JJV4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacng4Q9JJV4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacng4Q9JJV4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacng4Q9JJV4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cacng4Q9JJV4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cacng4Q9JJV4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms