Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnmb4Q9JIN6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnmb4Q9JIN6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnmb4Q9JIN6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnmb4Q9JIN6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnmb4Q9JIN6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnmb4Q9JIN6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kcnmb4Q9JIN6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnmb4Q9JIN6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnmb4Q9JIN6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnmb4Q9JIN6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnmb4Q9JIN6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnmb4Q9JIN6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcnmb4Q9JIN6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnmb4Q9JIN6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnmb4Q9JIN6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnmb4Q9JIN6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnmb4Q9JIN6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnmb4Q9JIN6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnmb4Q9JIN6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnmb4Q9JIN6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcnmb4Q9JIN6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnmb4Q9JIN6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnmb4Q9JIN6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnmb4Q9JIN6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnmb4Q9JIN6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnmb4Q9JIN6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnmb4Q9JIN6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnmb4Q9JIN6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnmb4Q9JIN6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnmb4Q9JIN6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnmb4Q9JIN6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnmb4Q9JIN6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnmb4Q9JIN6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnmb4Q9JIN6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnmb4Q9JIN6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnmb4Q9JIN6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnmb4Q9JIN6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnmb4Q9JIN6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnmb4Q9JIN6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnmb4Q9JIN6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnmb4Q9JIN6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnmb4Q9JIN6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnmb4Q9JIN6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnmb4Q9JIN6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnmb4Q9JIN6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnmb4Q9JIN6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnmb4Q9JIN6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnmb4Q9JIN6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnmb4Q9JIN6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnmb4Q9JIN6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnmb4Q9JIN6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnmb4Q9JIN6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnmb4Q9JIN6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnmb4Q9JIN6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnmb4Q9JIN6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnmb4Q9JIN6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnmb4Q9JIN6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnmb4Q9JIN6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnmb4Q9JIN6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnmb4Q9JIN6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnmb4Q9JIN6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnmb4Q9JIN6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnmb4Q9JIN6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnmb4Q9JIN6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnmb4Q9JIN6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnmb4Q9JIN6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnmb4Q9JIN6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kcnmb4Q9JIN6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnmb4Q9JIN6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnmb4Q9JIN6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnmb4Q9JIN6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnmb4Q9JIN6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnmb4Q9JIN6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnmb4Q9JIN6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnmb4Q9JIN6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnmb4Q9JIN6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnmb4Q9JIN6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnmb4Q9JIN6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnmb4Q9JIN6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnmb4Q9JIN6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnmb4Q9JIN6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnmb4Q9JIN6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnmb4Q9JIN6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnmb4Q9JIN6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnmb4Q9JIN6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnmb4Q9JIN6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnmb4Q9JIN6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnmb4Q9JIN6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnmb4Q9JIN6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnmb4Q9JIN6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnmb4Q9JIN6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnmb4Q9JIN6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnmb4Q9JIN6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnmb4Q9JIN6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms