Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI91

Actn2, Alpha-actinin-2, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn2Q9JI91 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Actn2Q9JI91 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Actn2Q9JI91 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Actn2Q9JI91 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Actn2Q9JI91 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Actn2Q9JI91 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.55■■■□□ 2
Actn2Q9JI91 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Actn2Q9JI91 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Actn2Q9JI91 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Actn2Q9JI91 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Actn2Q9JI91 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Actn2Q9JI91 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Actn2Q9JI91 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Actn2Q9JI91 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Actn2Q9JI91 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Actn2Q9JI91 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Actn2Q9JI91 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Actn2Q9JI91 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Actn2Q9JI91 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Actn2Q9JI91 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Actn2Q9JI91 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Actn2Q9JI91 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Actn2Q9JI91 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Actn2Q9JI91 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Actn2Q9JI91 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Actn2Q9JI91 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Actn2Q9JI91 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Actn2Q9JI91 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Actn2Q9JI91 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Actn2Q9JI91 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Actn2Q9JI91 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Actn2Q9JI91 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Actn2Q9JI91 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Actn2Q9JI91 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Actn2Q9JI91 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Actn2Q9JI91 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Actn2Q9JI91 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Actn2Q9JI91 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Actn2Q9JI91 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Actn2Q9JI91 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Actn2Q9JI91 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Actn2Q9JI91 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Actn2Q9JI91 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Actn2Q9JI91 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Actn2Q9JI91 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Actn2Q9JI91 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Actn2Q9JI91 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Actn2Q9JI91 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Actn2Q9JI91 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Actn2Q9JI91 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Actn2Q9JI91 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Actn2Q9JI91 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Actn2Q9JI91 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Actn2Q9JI91 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Actn2Q9JI91 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Actn2Q9JI91 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Actn2Q9JI91 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Actn2Q9JI91 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Actn2Q9JI91 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Actn2Q9JI91 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Actn2Q9JI91 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Actn2Q9JI91 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Actn2Q9JI91 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Actn2Q9JI91 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Actn2Q9JI91 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Actn2Q9JI91 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Actn2Q9JI91 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Actn2Q9JI91 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Actn2Q9JI91 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Actn2Q9JI91 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Actn2Q9JI91 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Actn2Q9JI91 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Actn2Q9JI91 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Actn2Q9JI91 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Actn2Q9JI91 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Actn2Q9JI91 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Actn2Q9JI91 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Actn2Q9JI91 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Actn2Q9JI91 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Actn2Q9JI91 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Actn2Q9JI91 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Actn2Q9JI91 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Actn2Q9JI91 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Actn2Q9JI91 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Actn2Q9JI91 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Actn2Q9JI91 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Actn2Q9JI91 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Actn2Q9JI91 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Actn2Q9JI91 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Actn2Q9JI91 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Actn2Q9JI91 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Actn2Q9JI91 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Actn2Q9JI91 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Actn2Q9JI91 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Actn2Q9JI91 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Actn2Q9JI91 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Actn2Q9JI91 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Actn2Q9JI91 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Actn2Q9JI91 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Actn2Q9JI91 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms