Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Irx6Q9ER75 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Irx6Q9ER75 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Irx6Q9ER75 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Irx6Q9ER75 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Irx6Q9ER75 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Irx6Q9ER75 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Irx6Q9ER75 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Irx6Q9ER75 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Irx6Q9ER75 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Irx6Q9ER75 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Irx6Q9ER75 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Irx6Q9ER75 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Irx6Q9ER75 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Irx6Q9ER75 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Irx6Q9ER75 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Irx6Q9ER75 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Irx6Q9ER75 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Irx6Q9ER75 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Irx6Q9ER75 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Irx6Q9ER75 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Irx6Q9ER75 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Irx6Q9ER75 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Irx6Q9ER75 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Irx6Q9ER75 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Irx6Q9ER75 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Irx6Q9ER75 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Irx6Q9ER75 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Irx6Q9ER75 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Irx6Q9ER75 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Irx6Q9ER75 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Irx6Q9ER75 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Irx6Q9ER75 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Irx6Q9ER75 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Irx6Q9ER75 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Irx6Q9ER75 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Irx6Q9ER75 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Irx6Q9ER75 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Irx6Q9ER75 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Irx6Q9ER75 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Irx6Q9ER75 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Irx6Q9ER75 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Irx6Q9ER75 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Irx6Q9ER75 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Irx6Q9ER75 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Irx6Q9ER75 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Irx6Q9ER75 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Irx6Q9ER75 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Irx6Q9ER75 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Irx6Q9ER75 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Irx6Q9ER75 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Irx6Q9ER75 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Irx6Q9ER75 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Irx6Q9ER75 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Irx6Q9ER75 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Irx6Q9ER75 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Irx6Q9ER75 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Irx6Q9ER75 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Irx6Q9ER75 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Irx6Q9ER75 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Irx6Q9ER75 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
Irx6Q9ER75 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Irx6Q9ER75 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Irx6Q9ER75 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Irx6Q9ER75 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Irx6Q9ER75 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Irx6Q9ER75 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Irx6Q9ER75 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Irx6Q9ER75 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Irx6Q9ER75 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Irx6Q9ER75 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Irx6Q9ER75 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Irx6Q9ER75 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Irx6Q9ER75 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Irx6Q9ER75 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Irx6Q9ER75 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Irx6Q9ER75 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Irx6Q9ER75 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Irx6Q9ER75 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Irx6Q9ER75 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Irx6Q9ER75 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Irx6Q9ER75 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Irx6Q9ER75 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Irx6Q9ER75 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Irx6Q9ER75 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Irx6Q9ER75 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Irx6Q9ER75 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Irx6Q9ER75 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Irx6Q9ER75 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Irx6Q9ER75 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Irx6Q9ER75 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Irx6Q9ER75 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Irx6Q9ER75 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Irx6Q9ER75 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Irx6Q9ER75 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Irx6Q9ER75 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Irx6Q9ER75 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Irx6Q9ER75 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Irx6Q9ER75 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Irx6Q9ER75 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms