Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hmgn3Q9DCB1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hmgn3Q9DCB1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmgn3Q9DCB1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmgn3Q9DCB1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmgn3Q9DCB1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmgn3Q9DCB1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hmgn3Q9DCB1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmgn3Q9DCB1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmgn3Q9DCB1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgn3Q9DCB1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgn3Q9DCB1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgn3Q9DCB1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hmgn3Q9DCB1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgn3Q9DCB1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgn3Q9DCB1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgn3Q9DCB1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmgn3Q9DCB1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmgn3Q9DCB1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmgn3Q9DCB1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmgn3Q9DCB1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgn3Q9DCB1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgn3Q9DCB1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgn3Q9DCB1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgn3Q9DCB1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmgn3Q9DCB1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmgn3Q9DCB1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgn3Q9DCB1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgn3Q9DCB1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgn3Q9DCB1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgn3Q9DCB1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgn3Q9DCB1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgn3Q9DCB1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgn3Q9DCB1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgn3Q9DCB1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgn3Q9DCB1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgn3Q9DCB1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgn3Q9DCB1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgn3Q9DCB1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgn3Q9DCB1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgn3Q9DCB1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgn3Q9DCB1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgn3Q9DCB1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgn3Q9DCB1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmgn3Q9DCB1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmgn3Q9DCB1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Hmgn3Q9DCB1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmgn3Q9DCB1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmgn3Q9DCB1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmgn3Q9DCB1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmgn3Q9DCB1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmgn3Q9DCB1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmgn3Q9DCB1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmgn3Q9DCB1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmgn3Q9DCB1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmgn3Q9DCB1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmgn3Q9DCB1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmgn3Q9DCB1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmgn3Q9DCB1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmgn3Q9DCB1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgn3Q9DCB1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgn3Q9DCB1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgn3Q9DCB1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmgn3Q9DCB1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hmgn3Q9DCB1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgn3Q9DCB1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmgn3Q9DCB1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmgn3Q9DCB1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmgn3Q9DCB1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmgn3Q9DCB1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmgn3Q9DCB1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmgn3Q9DCB1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmgn3Q9DCB1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmgn3Q9DCB1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmgn3Q9DCB1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmgn3Q9DCB1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmgn3Q9DCB1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmgn3Q9DCB1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmgn3Q9DCB1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmgn3Q9DCB1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmgn3Q9DCB1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hmgn3Q9DCB1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hmgn3Q9DCB1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmgn3Q9DCB1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmgn3Q9DCB1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmgn3Q9DCB1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmgn3Q9DCB1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmgn3Q9DCB1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmgn3Q9DCB1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmgn3Q9DCB1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmgn3Q9DCB1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmgn3Q9DCB1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hmgn3Q9DCB1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmgn3Q9DCB1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmgn3Q9DCB1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmgn3Q9DCB1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 287.1 ms