Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBN5

Lonp2, Lon protease homolog 2, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonp2Q9DBN5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lonp2Q9DBN5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lonp2Q9DBN5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Lonp2Q9DBN5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lonp2Q9DBN5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lonp2Q9DBN5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lonp2Q9DBN5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lonp2Q9DBN5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lonp2Q9DBN5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lonp2Q9DBN5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lonp2Q9DBN5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lonp2Q9DBN5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lonp2Q9DBN5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lonp2Q9DBN5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lonp2Q9DBN5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lonp2Q9DBN5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lonp2Q9DBN5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lonp2Q9DBN5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lonp2Q9DBN5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lonp2Q9DBN5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lonp2Q9DBN5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lonp2Q9DBN5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lonp2Q9DBN5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lonp2Q9DBN5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lonp2Q9DBN5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lonp2Q9DBN5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lonp2Q9DBN5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lonp2Q9DBN5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lonp2Q9DBN5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lonp2Q9DBN5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lonp2Q9DBN5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lonp2Q9DBN5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lonp2Q9DBN5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Lonp2Q9DBN5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lonp2Q9DBN5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lonp2Q9DBN5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lonp2Q9DBN5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lonp2Q9DBN5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lonp2Q9DBN5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lonp2Q9DBN5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lonp2Q9DBN5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lonp2Q9DBN5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lonp2Q9DBN5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lonp2Q9DBN5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lonp2Q9DBN5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lonp2Q9DBN5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lonp2Q9DBN5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lonp2Q9DBN5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lonp2Q9DBN5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Lonp2Q9DBN5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lonp2Q9DBN5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lonp2Q9DBN5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lonp2Q9DBN5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lonp2Q9DBN5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lonp2Q9DBN5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lonp2Q9DBN5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lonp2Q9DBN5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lonp2Q9DBN5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Lonp2Q9DBN5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lonp2Q9DBN5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lonp2Q9DBN5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lonp2Q9DBN5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lonp2Q9DBN5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lonp2Q9DBN5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lonp2Q9DBN5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lonp2Q9DBN5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lonp2Q9DBN5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lonp2Q9DBN5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Lonp2Q9DBN5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lonp2Q9DBN5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lonp2Q9DBN5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lonp2Q9DBN5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lonp2Q9DBN5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lonp2Q9DBN5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lonp2Q9DBN5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lonp2Q9DBN5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lonp2Q9DBN5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lonp2Q9DBN5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lonp2Q9DBN5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lonp2Q9DBN5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lonp2Q9DBN5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lonp2Q9DBN5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lonp2Q9DBN5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lonp2Q9DBN5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lonp2Q9DBN5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lonp2Q9DBN5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lonp2Q9DBN5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lonp2Q9DBN5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lonp2Q9DBN5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lonp2Q9DBN5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lonp2Q9DBN5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lonp2Q9DBN5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lonp2Q9DBN5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lonp2Q9DBN5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lonp2Q9DBN5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lonp2Q9DBN5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lonp2Q9DBN5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lonp2Q9DBN5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lonp2Q9DBN5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lonp2Q9DBN5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms