Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB60

Fam213b, Prostamide/prostaglandin F synthase, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam213bQ9DB60 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam213bQ9DB60 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam213bQ9DB60 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam213bQ9DB60 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam213bQ9DB60 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam213bQ9DB60 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam213bQ9DB60 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam213bQ9DB60 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam213bQ9DB60 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam213bQ9DB60 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam213bQ9DB60 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam213bQ9DB60 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam213bQ9DB60 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam213bQ9DB60 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam213bQ9DB60 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam213bQ9DB60 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam213bQ9DB60 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam213bQ9DB60 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam213bQ9DB60 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam213bQ9DB60 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam213bQ9DB60 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam213bQ9DB60 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam213bQ9DB60 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam213bQ9DB60 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam213bQ9DB60 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam213bQ9DB60 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam213bQ9DB60 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam213bQ9DB60 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam213bQ9DB60 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam213bQ9DB60 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam213bQ9DB60 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam213bQ9DB60 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam213bQ9DB60 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam213bQ9DB60 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam213bQ9DB60 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam213bQ9DB60 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam213bQ9DB60 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam213bQ9DB60 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam213bQ9DB60 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam213bQ9DB60 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam213bQ9DB60 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam213bQ9DB60 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam213bQ9DB60 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam213bQ9DB60 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam213bQ9DB60 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam213bQ9DB60 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam213bQ9DB60 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam213bQ9DB60 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam213bQ9DB60 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam213bQ9DB60 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam213bQ9DB60 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam213bQ9DB60 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam213bQ9DB60 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam213bQ9DB60 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam213bQ9DB60 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam213bQ9DB60 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam213bQ9DB60 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam213bQ9DB60 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam213bQ9DB60 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam213bQ9DB60 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam213bQ9DB60 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam213bQ9DB60 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam213bQ9DB60 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam213bQ9DB60 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam213bQ9DB60 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam213bQ9DB60 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam213bQ9DB60 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam213bQ9DB60 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam213bQ9DB60 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam213bQ9DB60 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam213bQ9DB60 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam213bQ9DB60 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam213bQ9DB60 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam213bQ9DB60 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam213bQ9DB60 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam213bQ9DB60 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam213bQ9DB60 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam213bQ9DB60 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam213bQ9DB60 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam213bQ9DB60 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam213bQ9DB60 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam213bQ9DB60 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam213bQ9DB60 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam213bQ9DB60 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam213bQ9DB60 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam213bQ9DB60 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam213bQ9DB60 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam213bQ9DB60 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam213bQ9DB60 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms