Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp12Q9D9M2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp12Q9D9M2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp12Q9D9M2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp12Q9D9M2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp12Q9D9M2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp12Q9D9M2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp12Q9D9M2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp12Q9D9M2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp12Q9D9M2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp12Q9D9M2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp12Q9D9M2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp12Q9D9M2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp12Q9D9M2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp12Q9D9M2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp12Q9D9M2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp12Q9D9M2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp12Q9D9M2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp12Q9D9M2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp12Q9D9M2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp12Q9D9M2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp12Q9D9M2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp12Q9D9M2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp12Q9D9M2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp12Q9D9M2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp12Q9D9M2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp12Q9D9M2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp12Q9D9M2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp12Q9D9M2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp12Q9D9M2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp12Q9D9M2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp12Q9D9M2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp12Q9D9M2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp12Q9D9M2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp12Q9D9M2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp12Q9D9M2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp12Q9D9M2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp12Q9D9M2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp12Q9D9M2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp12Q9D9M2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp12Q9D9M2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp12Q9D9M2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp12Q9D9M2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp12Q9D9M2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp12Q9D9M2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp12Q9D9M2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp12Q9D9M2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp12Q9D9M2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp12Q9D9M2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp12Q9D9M2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp12Q9D9M2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp12Q9D9M2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp12Q9D9M2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp12Q9D9M2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp12Q9D9M2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp12Q9D9M2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp12Q9D9M2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp12Q9D9M2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp12Q9D9M2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp12Q9D9M2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp12Q9D9M2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp12Q9D9M2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp12Q9D9M2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp12Q9D9M2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp12Q9D9M2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp12Q9D9M2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp12Q9D9M2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp12Q9D9M2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp12Q9D9M2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp12Q9D9M2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp12Q9D9M2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp12Q9D9M2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp12Q9D9M2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp12Q9D9M2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp12Q9D9M2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp12Q9D9M2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp12Q9D9M2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp12Q9D9M2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp12Q9D9M2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp12Q9D9M2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp12Q9D9M2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp12Q9D9M2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp12Q9D9M2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp12Q9D9M2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp12Q9D9M2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp12Q9D9M2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp12Q9D9M2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp12Q9D9M2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp12Q9D9M2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp12Q9D9M2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp12Q9D9M2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp12Q9D9M2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp12Q9D9M2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp12Q9D9M2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp12Q9D9M2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp12Q9D9M2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp12Q9D9M2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp12Q9D9M2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp12Q9D9M2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp12Q9D9M2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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