Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldnd2Q9D9H2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldnd2Q9D9H2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldnd2Q9D9H2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldnd2Q9D9H2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldnd2Q9D9H2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldnd2Q9D9H2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldnd2Q9D9H2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldnd2Q9D9H2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldnd2Q9D9H2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldnd2Q9D9H2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldnd2Q9D9H2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldnd2Q9D9H2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldnd2Q9D9H2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldnd2Q9D9H2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldnd2Q9D9H2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldnd2Q9D9H2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldnd2Q9D9H2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldnd2Q9D9H2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldnd2Q9D9H2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldnd2Q9D9H2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldnd2Q9D9H2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldnd2Q9D9H2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldnd2Q9D9H2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldnd2Q9D9H2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldnd2Q9D9H2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldnd2Q9D9H2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldnd2Q9D9H2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldnd2Q9D9H2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldnd2Q9D9H2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldnd2Q9D9H2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldnd2Q9D9H2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldnd2Q9D9H2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldnd2Q9D9H2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldnd2Q9D9H2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldnd2Q9D9H2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldnd2Q9D9H2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldnd2Q9D9H2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldnd2Q9D9H2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldnd2Q9D9H2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldnd2Q9D9H2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldnd2Q9D9H2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldnd2Q9D9H2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldnd2Q9D9H2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldnd2Q9D9H2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldnd2Q9D9H2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldnd2Q9D9H2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldnd2Q9D9H2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldnd2Q9D9H2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldnd2Q9D9H2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldnd2Q9D9H2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldnd2Q9D9H2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldnd2Q9D9H2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldnd2Q9D9H2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldnd2Q9D9H2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldnd2Q9D9H2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldnd2Q9D9H2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldnd2Q9D9H2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldnd2Q9D9H2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldnd2Q9D9H2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldnd2Q9D9H2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldnd2Q9D9H2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldnd2Q9D9H2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldnd2Q9D9H2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldnd2Q9D9H2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldnd2Q9D9H2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldnd2Q9D9H2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldnd2Q9D9H2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldnd2Q9D9H2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldnd2Q9D9H2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldnd2Q9D9H2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldnd2Q9D9H2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldnd2Q9D9H2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldnd2Q9D9H2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldnd2Q9D9H2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldnd2Q9D9H2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldnd2Q9D9H2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldnd2Q9D9H2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldnd2Q9D9H2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldnd2Q9D9H2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldnd2Q9D9H2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldnd2Q9D9H2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldnd2Q9D9H2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldnd2Q9D9H2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldnd2Q9D9H2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldnd2Q9D9H2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldnd2Q9D9H2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldnd2Q9D9H2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldnd2Q9D9H2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldnd2Q9D9H2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldnd2Q9D9H2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldnd2Q9D9H2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldnd2Q9D9H2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldnd2Q9D9H2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldnd2Q9D9H2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldnd2Q9D9H2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldnd2Q9D9H2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldnd2Q9D9H2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldnd2Q9D9H2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldnd2Q9D9H2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms