Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx5Q9D8U8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx5Q9D8U8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx5Q9D8U8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx5Q9D8U8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx5Q9D8U8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx5Q9D8U8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx5Q9D8U8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx5Q9D8U8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx5Q9D8U8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx5Q9D8U8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx5Q9D8U8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx5Q9D8U8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx5Q9D8U8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx5Q9D8U8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx5Q9D8U8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx5Q9D8U8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx5Q9D8U8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx5Q9D8U8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx5Q9D8U8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx5Q9D8U8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx5Q9D8U8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx5Q9D8U8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx5Q9D8U8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx5Q9D8U8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx5Q9D8U8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx5Q9D8U8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx5Q9D8U8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx5Q9D8U8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx5Q9D8U8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx5Q9D8U8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx5Q9D8U8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx5Q9D8U8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx5Q9D8U8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx5Q9D8U8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx5Q9D8U8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx5Q9D8U8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx5Q9D8U8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx5Q9D8U8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx5Q9D8U8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx5Q9D8U8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx5Q9D8U8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx5Q9D8U8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx5Q9D8U8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx5Q9D8U8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx5Q9D8U8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx5Q9D8U8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx5Q9D8U8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx5Q9D8U8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx5Q9D8U8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx5Q9D8U8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx5Q9D8U8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx5Q9D8U8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx5Q9D8U8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx5Q9D8U8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx5Q9D8U8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx5Q9D8U8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx5Q9D8U8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx5Q9D8U8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx5Q9D8U8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx5Q9D8U8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx5Q9D8U8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx5Q9D8U8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx5Q9D8U8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx5Q9D8U8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx5Q9D8U8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx5Q9D8U8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx5Q9D8U8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx5Q9D8U8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx5Q9D8U8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx5Q9D8U8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx5Q9D8U8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx5Q9D8U8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx5Q9D8U8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx5Q9D8U8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx5Q9D8U8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx5Q9D8U8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx5Q9D8U8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx5Q9D8U8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snx5Q9D8U8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx5Q9D8U8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx5Q9D8U8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx5Q9D8U8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx5Q9D8U8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx5Q9D8U8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx5Q9D8U8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx5Q9D8U8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx5Q9D8U8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx5Q9D8U8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx5Q9D8U8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx5Q9D8U8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx5Q9D8U8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx5Q9D8U8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx5Q9D8U8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx5Q9D8U8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx5Q9D8U8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx5Q9D8U8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx5Q9D8U8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx5Q9D8U8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snx5Q9D8U8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms