Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cyp2c55Q9D816 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cyp2c55Q9D816 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cyp2c55Q9D816 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cyp2c55Q9D816 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cyp2c55Q9D816 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cyp2c55Q9D816 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cyp2c55Q9D816 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cyp2c55Q9D816 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cyp2c55Q9D816 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cyp2c55Q9D816 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cyp2c55Q9D816 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cyp2c55Q9D816 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cyp2c55Q9D816 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cyp2c55Q9D816 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cyp2c55Q9D816 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cyp2c55Q9D816 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cyp2c55Q9D816 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cyp2c55Q9D816 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cyp2c55Q9D816 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cyp2c55Q9D816 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cyp2c55Q9D816 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cyp2c55Q9D816 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cyp2c55Q9D816 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyp2c55Q9D816 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyp2c55Q9D816 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyp2c55Q9D816 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cyp2c55Q9D816 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cyp2c55Q9D816 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp2c55Q9D816 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cyp2c55Q9D816 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyp2c55Q9D816 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyp2c55Q9D816 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cyp2c55Q9D816 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cyp2c55Q9D816 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cyp2c55Q9D816 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cyp2c55Q9D816 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cyp2c55Q9D816 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyp2c55Q9D816 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cyp2c55Q9D816 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cyp2c55Q9D816 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp2c55Q9D816 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp2c55Q9D816 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp2c55Q9D816 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp2c55Q9D816 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp2c55Q9D816 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp2c55Q9D816 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp2c55Q9D816 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cyp2c55Q9D816 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cyp2c55Q9D816 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyp2c55Q9D816 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyp2c55Q9D816 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyp2c55Q9D816 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cyp2c55Q9D816 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyp2c55Q9D816 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp2c55Q9D816 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp2c55Q9D816 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyp2c55Q9D816 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyp2c55Q9D816 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cyp2c55Q9D816 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cyp2c55Q9D816 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cyp2c55Q9D816 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cyp2c55Q9D816 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cyp2c55Q9D816 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cyp2c55Q9D816 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cyp2c55Q9D816 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cyp2c55Q9D816 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cyp2c55Q9D816 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cyp2c55Q9D816 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp2c55Q9D816 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp2c55Q9D816 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cyp2c55Q9D816 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cyp2c55Q9D816 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cyp2c55Q9D816 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cyp2c55Q9D816 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cyp2c55Q9D816 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cyp2c55Q9D816 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cyp2c55Q9D816 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cyp2c55Q9D816 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Cyp2c55Q9D816 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cyp2c55Q9D816 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cyp2c55Q9D816 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cyp2c55Q9D816 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cyp2c55Q9D816 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cyp2c55Q9D816 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cyp2c55Q9D816 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cyp2c55Q9D816 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cyp2c55Q9D816 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cyp2c55Q9D816 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cyp2c55Q9D816 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cyp2c55Q9D816 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cyp2c55Q9D816 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cyp2c55Q9D816 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cyp2c55Q9D816 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cyp2c55Q9D816 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cyp2c55Q9D816 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cyp2c55Q9D816 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cyp2c55Q9D816 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cyp2c55Q9D816 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cyp2c55Q9D816 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms