Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5R4

Spata1, Spermatogenesis-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata1Q9D5R4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spata1Q9D5R4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spata1Q9D5R4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spata1Q9D5R4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spata1Q9D5R4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Spata1Q9D5R4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Spata1Q9D5R4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spata1Q9D5R4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spata1Q9D5R4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spata1Q9D5R4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spata1Q9D5R4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spata1Q9D5R4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Spata1Q9D5R4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spata1Q9D5R4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spata1Q9D5R4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spata1Q9D5R4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spata1Q9D5R4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spata1Q9D5R4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spata1Q9D5R4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Spata1Q9D5R4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spata1Q9D5R4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spata1Q9D5R4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spata1Q9D5R4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Spata1Q9D5R4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spata1Q9D5R4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spata1Q9D5R4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spata1Q9D5R4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spata1Q9D5R4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spata1Q9D5R4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spata1Q9D5R4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spata1Q9D5R4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spata1Q9D5R4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spata1Q9D5R4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spata1Q9D5R4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spata1Q9D5R4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spata1Q9D5R4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spata1Q9D5R4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spata1Q9D5R4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spata1Q9D5R4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spata1Q9D5R4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spata1Q9D5R4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Spata1Q9D5R4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spata1Q9D5R4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spata1Q9D5R4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spata1Q9D5R4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spata1Q9D5R4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spata1Q9D5R4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spata1Q9D5R4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Spata1Q9D5R4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spata1Q9D5R4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spata1Q9D5R4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spata1Q9D5R4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spata1Q9D5R4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spata1Q9D5R4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spata1Q9D5R4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spata1Q9D5R4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spata1Q9D5R4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spata1Q9D5R4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spata1Q9D5R4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spata1Q9D5R4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spata1Q9D5R4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spata1Q9D5R4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spata1Q9D5R4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spata1Q9D5R4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spata1Q9D5R4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spata1Q9D5R4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spata1Q9D5R4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spata1Q9D5R4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spata1Q9D5R4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Spata1Q9D5R4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spata1Q9D5R4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spata1Q9D5R4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spata1Q9D5R4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spata1Q9D5R4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spata1Q9D5R4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spata1Q9D5R4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spata1Q9D5R4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spata1Q9D5R4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Spata1Q9D5R4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spata1Q9D5R4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spata1Q9D5R4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spata1Q9D5R4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spata1Q9D5R4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spata1Q9D5R4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spata1Q9D5R4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spata1Q9D5R4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spata1Q9D5R4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spata1Q9D5R4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spata1Q9D5R4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spata1Q9D5R4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spata1Q9D5R4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spata1Q9D5R4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spata1Q9D5R4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spata1Q9D5R4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spata1Q9D5R4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Spata1Q9D5R4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Spata1Q9D5R4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Spata1Q9D5R4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spata1Q9D5R4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spata1Q9D5R4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms