Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S6

Erich6b, Glutamate-rich 6B, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich6bQ9D4S6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Erich6bQ9D4S6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Erich6bQ9D4S6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Erich6bQ9D4S6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Erich6bQ9D4S6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Erich6bQ9D4S6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Erich6bQ9D4S6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Erich6bQ9D4S6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Erich6bQ9D4S6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Erich6bQ9D4S6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Erich6bQ9D4S6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Erich6bQ9D4S6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Erich6bQ9D4S6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Erich6bQ9D4S6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Erich6bQ9D4S6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Erich6bQ9D4S6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Erich6bQ9D4S6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Erich6bQ9D4S6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Erich6bQ9D4S6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Erich6bQ9D4S6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Erich6bQ9D4S6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Erich6bQ9D4S6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Erich6bQ9D4S6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Erich6bQ9D4S6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Erich6bQ9D4S6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Erich6bQ9D4S6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Erich6bQ9D4S6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Erich6bQ9D4S6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Erich6bQ9D4S6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Erich6bQ9D4S6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Erich6bQ9D4S6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Erich6bQ9D4S6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Erich6bQ9D4S6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Erich6bQ9D4S6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Erich6bQ9D4S6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Erich6bQ9D4S6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Erich6bQ9D4S6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Erich6bQ9D4S6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Erich6bQ9D4S6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Erich6bQ9D4S6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Erich6bQ9D4S6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Erich6bQ9D4S6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Erich6bQ9D4S6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Erich6bQ9D4S6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Erich6bQ9D4S6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Erich6bQ9D4S6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Erich6bQ9D4S6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Erich6bQ9D4S6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Erich6bQ9D4S6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Erich6bQ9D4S6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Erich6bQ9D4S6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Erich6bQ9D4S6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Erich6bQ9D4S6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Erich6bQ9D4S6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Erich6bQ9D4S6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Erich6bQ9D4S6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Erich6bQ9D4S6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Erich6bQ9D4S6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Erich6bQ9D4S6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Erich6bQ9D4S6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Erich6bQ9D4S6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Erich6bQ9D4S6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Erich6bQ9D4S6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Erich6bQ9D4S6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Erich6bQ9D4S6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Erich6bQ9D4S6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Erich6bQ9D4S6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Erich6bQ9D4S6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Erich6bQ9D4S6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Erich6bQ9D4S6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Erich6bQ9D4S6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Erich6bQ9D4S6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Erich6bQ9D4S6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Erich6bQ9D4S6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Erich6bQ9D4S6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Erich6bQ9D4S6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Erich6bQ9D4S6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Erich6bQ9D4S6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Erich6bQ9D4S6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Erich6bQ9D4S6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Erich6bQ9D4S6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Erich6bQ9D4S6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Erich6bQ9D4S6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Erich6bQ9D4S6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Erich6bQ9D4S6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Erich6bQ9D4S6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Erich6bQ9D4S6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Erich6bQ9D4S6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Erich6bQ9D4S6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Erich6bQ9D4S6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Erich6bQ9D4S6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Erich6bQ9D4S6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Erich6bQ9D4S6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Erich6bQ9D4S6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Erich6bQ9D4S6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Erich6bQ9D4S6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Erich6bQ9D4S6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Erich6bQ9D4S6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Erich6bQ9D4S6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Erich6bQ9D4S6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms