Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
5430402E10RikQ9D3N5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
5430402E10RikQ9D3N5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
5430402E10RikQ9D3N5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
5430402E10RikQ9D3N5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
5430402E10RikQ9D3N5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
5430402E10RikQ9D3N5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
5430402E10RikQ9D3N5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
5430402E10RikQ9D3N5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
5430402E10RikQ9D3N5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
5430402E10RikQ9D3N5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
5430402E10RikQ9D3N5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
5430402E10RikQ9D3N5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
5430402E10RikQ9D3N5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
5430402E10RikQ9D3N5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
5430402E10RikQ9D3N5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
5430402E10RikQ9D3N5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
5430402E10RikQ9D3N5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
5430402E10RikQ9D3N5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
5430402E10RikQ9D3N5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
5430402E10RikQ9D3N5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
5430402E10RikQ9D3N5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
5430402E10RikQ9D3N5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
5430402E10RikQ9D3N5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
5430402E10RikQ9D3N5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
5430402E10RikQ9D3N5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
5430402E10RikQ9D3N5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
5430402E10RikQ9D3N5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
5430402E10RikQ9D3N5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
5430402E10RikQ9D3N5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
5430402E10RikQ9D3N5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
5430402E10RikQ9D3N5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
5430402E10RikQ9D3N5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
5430402E10RikQ9D3N5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
5430402E10RikQ9D3N5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
5430402E10RikQ9D3N5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
5430402E10RikQ9D3N5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
5430402E10RikQ9D3N5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
5430402E10RikQ9D3N5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
5430402E10RikQ9D3N5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
5430402E10RikQ9D3N5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
5430402E10RikQ9D3N5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
5430402E10RikQ9D3N5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
5430402E10RikQ9D3N5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
5430402E10RikQ9D3N5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
5430402E10RikQ9D3N5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
5430402E10RikQ9D3N5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
5430402E10RikQ9D3N5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
5430402E10RikQ9D3N5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
5430402E10RikQ9D3N5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
5430402E10RikQ9D3N5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
5430402E10RikQ9D3N5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
5430402E10RikQ9D3N5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
5430402E10RikQ9D3N5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
5430402E10RikQ9D3N5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
5430402E10RikQ9D3N5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
5430402E10RikQ9D3N5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
5430402E10RikQ9D3N5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
5430402E10RikQ9D3N5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
5430402E10RikQ9D3N5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
5430402E10RikQ9D3N5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
5430402E10RikQ9D3N5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
5430402E10RikQ9D3N5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
5430402E10RikQ9D3N5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
5430402E10RikQ9D3N5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
5430402E10RikQ9D3N5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
5430402E10RikQ9D3N5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
5430402E10RikQ9D3N5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
5430402E10RikQ9D3N5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
5430402E10RikQ9D3N5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
5430402E10RikQ9D3N5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
5430402E10RikQ9D3N5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
5430402E10RikQ9D3N5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
5430402E10RikQ9D3N5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
5430402E10RikQ9D3N5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
5430402E10RikQ9D3N5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
5430402E10RikQ9D3N5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
5430402E10RikQ9D3N5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
5430402E10RikQ9D3N5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
5430402E10RikQ9D3N5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
5430402E10RikQ9D3N5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
5430402E10RikQ9D3N5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
5430402E10RikQ9D3N5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
5430402E10RikQ9D3N5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
5430402E10RikQ9D3N5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
5430402E10RikQ9D3N5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
5430402E10RikQ9D3N5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
5430402E10RikQ9D3N5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
5430402E10RikQ9D3N5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
5430402E10RikQ9D3N5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
5430402E10RikQ9D3N5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
5430402E10RikQ9D3N5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
5430402E10RikQ9D3N5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
5430402E10RikQ9D3N5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
5430402E10RikQ9D3N5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
5430402E10RikQ9D3N5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
5430402E10RikQ9D3N5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms