Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hacd2Q9D3B1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hacd2Q9D3B1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hacd2Q9D3B1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hacd2Q9D3B1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hacd2Q9D3B1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hacd2Q9D3B1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hacd2Q9D3B1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hacd2Q9D3B1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hacd2Q9D3B1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hacd2Q9D3B1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hacd2Q9D3B1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hacd2Q9D3B1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hacd2Q9D3B1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hacd2Q9D3B1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hacd2Q9D3B1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hacd2Q9D3B1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hacd2Q9D3B1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hacd2Q9D3B1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hacd2Q9D3B1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hacd2Q9D3B1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hacd2Q9D3B1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hacd2Q9D3B1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hacd2Q9D3B1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hacd2Q9D3B1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hacd2Q9D3B1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hacd2Q9D3B1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hacd2Q9D3B1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hacd2Q9D3B1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Hacd2Q9D3B1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hacd2Q9D3B1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hacd2Q9D3B1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hacd2Q9D3B1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hacd2Q9D3B1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hacd2Q9D3B1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hacd2Q9D3B1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hacd2Q9D3B1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hacd2Q9D3B1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hacd2Q9D3B1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hacd2Q9D3B1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hacd2Q9D3B1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Hacd2Q9D3B1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hacd2Q9D3B1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hacd2Q9D3B1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hacd2Q9D3B1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hacd2Q9D3B1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hacd2Q9D3B1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hacd2Q9D3B1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hacd2Q9D3B1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hacd2Q9D3B1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hacd2Q9D3B1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hacd2Q9D3B1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hacd2Q9D3B1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hacd2Q9D3B1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hacd2Q9D3B1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hacd2Q9D3B1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hacd2Q9D3B1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hacd2Q9D3B1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hacd2Q9D3B1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hacd2Q9D3B1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hacd2Q9D3B1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hacd2Q9D3B1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Hacd2Q9D3B1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hacd2Q9D3B1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hacd2Q9D3B1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hacd2Q9D3B1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hacd2Q9D3B1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hacd2Q9D3B1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hacd2Q9D3B1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hacd2Q9D3B1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hacd2Q9D3B1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hacd2Q9D3B1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hacd2Q9D3B1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hacd2Q9D3B1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hacd2Q9D3B1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hacd2Q9D3B1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hacd2Q9D3B1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hacd2Q9D3B1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hacd2Q9D3B1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hacd2Q9D3B1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Hacd2Q9D3B1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hacd2Q9D3B1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hacd2Q9D3B1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hacd2Q9D3B1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hacd2Q9D3B1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hacd2Q9D3B1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hacd2Q9D3B1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hacd2Q9D3B1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hacd2Q9D3B1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hacd2Q9D3B1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hacd2Q9D3B1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hacd2Q9D3B1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Hacd2Q9D3B1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hacd2Q9D3B1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hacd2Q9D3B1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hacd2Q9D3B1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hacd2Q9D3B1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hacd2Q9D3B1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hacd2Q9D3B1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hacd2Q9D3B1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms