Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Fndc8Q9D2H8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Fndc8Q9D2H8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Fndc8Q9D2H8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Fndc8Q9D2H8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Fndc8Q9D2H8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Fndc8Q9D2H8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Fndc8Q9D2H8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Fndc8Q9D2H8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Fndc8Q9D2H8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Fndc8Q9D2H8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Fndc8Q9D2H8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Fndc8Q9D2H8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Fndc8Q9D2H8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Fndc8Q9D2H8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
Fndc8Q9D2H8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Fndc8Q9D2H8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Fndc8Q9D2H8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Fndc8Q9D2H8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Fndc8Q9D2H8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Fndc8Q9D2H8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Fndc8Q9D2H8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Fndc8Q9D2H8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Fndc8Q9D2H8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Fndc8Q9D2H8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
Fndc8Q9D2H8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Fndc8Q9D2H8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,81■■□□□ 1,56
Fndc8Q9D2H8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Fndc8Q9D2H8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Fndc8Q9D2H8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Fndc8Q9D2H8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Fndc8Q9D2H8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Fndc8Q9D2H8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Fndc8Q9D2H8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Fndc8Q9D2H8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Fndc8Q9D2H8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Fndc8Q9D2H8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Fndc8Q9D2H8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Fndc8Q9D2H8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Fndc8Q9D2H8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Fndc8Q9D2H8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Fndc8Q9D2H8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Fndc8Q9D2H8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Fndc8Q9D2H8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Fndc8Q9D2H8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Fndc8Q9D2H8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
Fndc8Q9D2H8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24,69■■□□□ 1,54
Fndc8Q9D2H8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Fndc8Q9D2H8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Fndc8Q9D2H8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Fndc8Q9D2H8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Fndc8Q9D2H8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Fndc8Q9D2H8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Fndc8Q9D2H8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Fndc8Q9D2H8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Fndc8Q9D2H8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Fndc8Q9D2H8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24,63■■□□□ 1,53
Fndc8Q9D2H8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Fndc8Q9D2H8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Fndc8Q9D2H8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Fndc8Q9D2H8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Fndc8Q9D2H8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
Fndc8Q9D2H8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Fndc8Q9D2H8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,52
Fndc8Q9D2H8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Fndc8Q9D2H8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Fndc8Q9D2H8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Fndc8Q9D2H8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Fndc8Q9D2H8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Fndc8Q9D2H8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Fndc8Q9D2H8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Fndc8Q9D2H8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Fndc8Q9D2H8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Fndc8Q9D2H8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Fndc8Q9D2H8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Fndc8Q9D2H8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Fndc8Q9D2H8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Fndc8Q9D2H8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Fndc8Q9D2H8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Fndc8Q9D2H8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Fndc8Q9D2H8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,45■■□□□ 1,5
Fndc8Q9D2H8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Fndc8Q9D2H8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Fndc8Q9D2H8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Fndc8Q9D2H8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Fndc8Q9D2H8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24,4■■□□□ 1,5
Fndc8Q9D2H8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,4■■□□□ 1,5
Fndc8Q9D2H8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Fndc8Q9D2H8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Fndc8Q9D2H8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Fndc8Q9D2H8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Fndc8Q9D2H8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Fndc8Q9D2H8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
Fndc8Q9D2H8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24,36■■□□□ 1,49
Fndc8Q9D2H8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Fndc8Q9D2H8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Fndc8Q9D2H8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Fndc8Q9D2H8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Fndc8Q9D2H8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
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