Protein–RNA interactions for Protein: Q9D253

9330161L09Rik, RIKEN cDNA 9330161L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9330161L09RikQ9D253 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
9330161L09RikQ9D253 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9330161L09RikQ9D253 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9330161L09RikQ9D253 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
9330161L09RikQ9D253 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
9330161L09RikQ9D253 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
9330161L09RikQ9D253 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
9330161L09RikQ9D253 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
9330161L09RikQ9D253 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
9330161L09RikQ9D253 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
9330161L09RikQ9D253 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
9330161L09RikQ9D253 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
9330161L09RikQ9D253 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9330161L09RikQ9D253 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9330161L09RikQ9D253 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9330161L09RikQ9D253 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
9330161L09RikQ9D253 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
9330161L09RikQ9D253 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
9330161L09RikQ9D253 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
9330161L09RikQ9D253 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
9330161L09RikQ9D253 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
9330161L09RikQ9D253 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
9330161L09RikQ9D253 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
9330161L09RikQ9D253 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
9330161L09RikQ9D253 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
9330161L09RikQ9D253 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
9330161L09RikQ9D253 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
9330161L09RikQ9D253 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
9330161L09RikQ9D253 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
9330161L09RikQ9D253 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
9330161L09RikQ9D253 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
9330161L09RikQ9D253 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
9330161L09RikQ9D253 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
9330161L09RikQ9D253 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
9330161L09RikQ9D253 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
9330161L09RikQ9D253 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
9330161L09RikQ9D253 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
9330161L09RikQ9D253 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9330161L09RikQ9D253 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9330161L09RikQ9D253 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9330161L09RikQ9D253 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
9330161L09RikQ9D253 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9330161L09RikQ9D253 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
9330161L09RikQ9D253 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
9330161L09RikQ9D253 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
9330161L09RikQ9D253 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
9330161L09RikQ9D253 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
9330161L09RikQ9D253 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
9330161L09RikQ9D253 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
9330161L09RikQ9D253 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
9330161L09RikQ9D253 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
9330161L09RikQ9D253 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
9330161L09RikQ9D253 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
9330161L09RikQ9D253 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
9330161L09RikQ9D253 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
9330161L09RikQ9D253 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
9330161L09RikQ9D253 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
9330161L09RikQ9D253 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
9330161L09RikQ9D253 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
9330161L09RikQ9D253 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
9330161L09RikQ9D253 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
9330161L09RikQ9D253 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
9330161L09RikQ9D253 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
9330161L09RikQ9D253 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
9330161L09RikQ9D253 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
9330161L09RikQ9D253 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
9330161L09RikQ9D253 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
9330161L09RikQ9D253 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
9330161L09RikQ9D253 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
9330161L09RikQ9D253 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
9330161L09RikQ9D253 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
9330161L09RikQ9D253 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
9330161L09RikQ9D253 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
9330161L09RikQ9D253 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
9330161L09RikQ9D253 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
9330161L09RikQ9D253 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
9330161L09RikQ9D253 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
9330161L09RikQ9D253 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
9330161L09RikQ9D253 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
9330161L09RikQ9D253 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
9330161L09RikQ9D253 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
9330161L09RikQ9D253 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
9330161L09RikQ9D253 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
9330161L09RikQ9D253 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
9330161L09RikQ9D253 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
9330161L09RikQ9D253 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
9330161L09RikQ9D253 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
9330161L09RikQ9D253 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
9330161L09RikQ9D253 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
9330161L09RikQ9D253 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
9330161L09RikQ9D253 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
9330161L09RikQ9D253 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
9330161L09RikQ9D253 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
9330161L09RikQ9D253 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
9330161L09RikQ9D253 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
9330161L09RikQ9D253 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
9330161L09RikQ9D253 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
9330161L09RikQ9D253 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
9330161L09RikQ9D253 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
9330161L09RikQ9D253 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms