Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nol3Q9D1X0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nol3Q9D1X0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nol3Q9D1X0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nol3Q9D1X0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nol3Q9D1X0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nol3Q9D1X0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nol3Q9D1X0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nol3Q9D1X0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nol3Q9D1X0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nol3Q9D1X0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nol3Q9D1X0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nol3Q9D1X0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nol3Q9D1X0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nol3Q9D1X0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nol3Q9D1X0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nol3Q9D1X0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nol3Q9D1X0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nol3Q9D1X0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nol3Q9D1X0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nol3Q9D1X0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nol3Q9D1X0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nol3Q9D1X0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nol3Q9D1X0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nol3Q9D1X0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nol3Q9D1X0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nol3Q9D1X0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nol3Q9D1X0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nol3Q9D1X0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nol3Q9D1X0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nol3Q9D1X0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nol3Q9D1X0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nol3Q9D1X0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nol3Q9D1X0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nol3Q9D1X0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nol3Q9D1X0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nol3Q9D1X0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nol3Q9D1X0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nol3Q9D1X0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nol3Q9D1X0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nol3Q9D1X0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nol3Q9D1X0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nol3Q9D1X0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nol3Q9D1X0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nol3Q9D1X0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nol3Q9D1X0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nol3Q9D1X0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nol3Q9D1X0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nol3Q9D1X0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nol3Q9D1X0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nol3Q9D1X0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nol3Q9D1X0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nol3Q9D1X0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nol3Q9D1X0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nol3Q9D1X0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nol3Q9D1X0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nol3Q9D1X0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nol3Q9D1X0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nol3Q9D1X0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nol3Q9D1X0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nol3Q9D1X0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nol3Q9D1X0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nol3Q9D1X0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nol3Q9D1X0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nol3Q9D1X0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nol3Q9D1X0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nol3Q9D1X0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nol3Q9D1X0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nol3Q9D1X0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nol3Q9D1X0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nol3Q9D1X0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nol3Q9D1X0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nol3Q9D1X0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nol3Q9D1X0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nol3Q9D1X0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nol3Q9D1X0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nol3Q9D1X0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nol3Q9D1X0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nol3Q9D1X0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nol3Q9D1X0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nol3Q9D1X0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nol3Q9D1X0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nol3Q9D1X0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nol3Q9D1X0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nol3Q9D1X0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nol3Q9D1X0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nol3Q9D1X0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nol3Q9D1X0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nol3Q9D1X0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nol3Q9D1X0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nol3Q9D1X0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nol3Q9D1X0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nol3Q9D1X0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nol3Q9D1X0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nol3Q9D1X0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nol3Q9D1X0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nol3Q9D1X0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nol3Q9D1X0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nol3Q9D1X0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nol3Q9D1X0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms